Les Hawkins, une famille aimante mais troublée, décident d'acheter un «Synth» appelé Anita, mais ils commencent à soupçonner qu'elle a quelque chose d'inhabituel...

Laura se sent de plus en plus menacée par la présence d'Anita, et les recherches de Leo deviennent de plus en plus dangereuses.

Laura est, à contrecœur, forcée de garder Anita lorsque celle-ci sauve Toby d'un accident de la route. George met en place son évasion avec Odi et la réaction brutale de Pete lui vaut une suspension de travail.

Laura insiste auprès de la famille pour tester Anita lorsque Mattie lui apprend qu'elle a vu Anita réagir étrangement, pendant qu'Hobb est sur la piste de Niska.

Le Synth tueur fait la une et la peur gagne de plus en plus la population. Karen se rapproche de la piste de Niska, mais ses motivations pour la retrouver sont-elles plus personnelles que professionnelles?

Le moral est au plus bas chez les Hawkins. Avec le départ de Joe et les mensonges envers leurs enfants, Laura décide qu'il est temps de dire la vérité.

Rejetée et seule, Karen part à la recherche de Niska chez George. En attendant Pete est déterminé à découvrir qui Karen est vraiment. Les Synthés poursuivis se refugient chez les Hawkins.

Avec la capture des Synths, les Hawkins se rendent compte à quel point est important pour eux Mia et les siens, et sont déterminés à les aider.

Niska trouve refuge à Berlin où elle se lie avec une jeune femme rencontrée dans un club. La synthèt décide de télécharger sur le réseau une mise à jour permettant de rendre ses congénères conscients. Peu à peu, partout dans le monde, certains s'éveillent et essaient d'échapper à leur quotidien. Les Hawkings, quant à eux, tentent de prendre un nouveau départ. Anita, quant à elle, cache ses capacités à son nouveau propriétaire.

Laura Hawkins refuse de représenter Niska mais accepte de se renseigner auprès du procureur pour savoir si un synthèt pourrait être jugé avec les mêmes droits qu'un humain. Le Dr Athena Morrow, de son côté, dissèque Artie pour tenter de comprendre d'où vient son état de conscience. Mais ses conclusions sont insuffisantes. Il lui faut un autre individu. Peu après, elle essaie de télécharger « V » dans le corps d'un synthèt.

Le Dr Athena Morrow rend visite à sa fille, qui est dans le coma depuis plusieurs années. Le père de la jeune femme envisage de débrancher les appareils qui la maintiennent en vie, mais Athena ne peut pas s'y résoudre. Leo découvre que le prisonnier qu'il détenait s'est échappé. Mia, de son côté, réalise qu'elle éprouve des sentiments pour Ed. Niska, quant à elle, est étudiée de près afin de déterminer si elle peut bénéficier d'un procès comme un humain.

Un psychiatre s'entretient avec Sophie et en conclut que la petite fille s'identifie à un synthèt. Ed, quant à lui, est dans une situation délicate. Il doit très rapidement payer les frais médicaux de sa mère pour éviter qu'elle ne soit expulsée de sa maison de retraite. Pour prouver que Niska ressent des émotions, Laura fait venir Astrid. Pete, de son côté, poursuit son enquête sur les Séraphins.

Ed et Danny tentent de vendre Mia, mais elle parvient à occulter sa conscience et à redevenir Anita. Le docteur Aveling ne l'identifie pas comme une synthèt consciente et menace les deux hommes de les dénoncer à la police s'ils ne la laissent pas tranquille. Joe emmène ses enfants passer la journée dans une ville qui a banni les synthèts. A leur retour, il dépose Toby qui souhaite retrouver Renie. Athéna révèle à V qu'elle est une simulation de l'esprit de sa fille qui vient juste de mourir après des années passées dans le coma. Hester et Léo capturent l'employée de Qualia qui a abattu Dix...

Mia est rentrée chez les Hawkins, mais elle est à nouveau Anita et Mattie n'est pas présente pour la réactiver. Pendant ce temps, cette dernière rejoint Léo et Hester qui veulent prendre d'assaut le Silo. Lorsqu'elle emprunte une porte électrifiée, Hester manque d'être mise hors service. Mia, enfin revenue à la conscience, a décidé de se battre et rejoint Léo. Niska, de son côté, est poursuivie par les autorités et découvre que l'ensemble des synthèts de la planète ont reçu l'ordre de signaler sa présence. Elle retourne voir Astrid pour tenter de se mettre à l'abri...

Chez les Hawkins, Sophie continue à prétendre être une synthétique. Son frère demande à Renie de s’entretenir avec elle. De retour chez ses parents, Mattie leur explique les plans de Leo et Mia. Pendant ce temps, cette dernière trouve un plan pour s’introduire chez Qualia et libérer ses congénères. Karen rend visite à Athena. Elle lui révèle son secret et lui demande de l’aider.

Suite aux récents événements, Leo est anéanti. Joe, de son côté, fait part à Laura de son désir de déménager dans une ville où les synthétiques sont interdits. Il pense que changer d’environnement pourrait être bénéfique pour les enfants, en particulier pour Sophie. Se présentant sous le nom de Molly, Hester se rend chez les Hawkins. Elle recherche Leo. Athena décide de quitter Qualia, mais refuse de leur laisser « V ».

Un an plus tard, Leo est toujours dans le coma, laissant Max, Mia et Flash seuls pour négocier une paix difficile avec le monde humain. Le combat que mène Laura reçoit un coup de pouce inattendu.

Une descente de police sur le Railyard force Max à gérer les conséquences de sa décision de vie ou de mort. La situation s'aggrave quand Agnès commence une campagne anti-humaine. Laura découvre une opération qui pourrait menacer la survie du synthé.

Alors que Leo se démène pour devenir humain, Mattie le ramène chez les Hawkins, où une soirée surprise leur permet de se confronter à leurs sentiments. Laura est déterminée à découvrir la vérité sur l'opération trop secrète Basswood et essaie d'obtenir l'aide du Dr Neil Sommer, seulement les choses prennent un tournant inattendu. Joe décide à contrecœur d'aider Karen avec Sam, et Niska reçoit un message mystérieux.

Laura mène une visite tendue de la Commission de Dryden au Railyard, mais la colère d'Agnès peut menacer le succès. Mia confronte son passé quand elle rencontre Ed. Une soirée se transforme en tragédie.

Sam doit faire face aux événements qui se passe à Waltringham et Joe essaie de l'aider à s'en sortir. Pendant ce temps, des vérités sont révélées et des plans dangereux sont mis en action au Railyard.

Laura découvre une nouvelle choquante qui menace sa via et celles de ceux qui l'entourent. Leo et Mattie retournent à la maison Elster où Leo fait une découverte douloureuse. Niska continue son voyage, où elle doit défier tous ses instincts pour survivre.

Max doit affronter un ami devenu ennemi. Laura prend une décision déchirante, mais quand Mattie dévoile son secret, elle se remet en action. Le voyage de Niska prend un tour inattendu, tandis que Leo court aux côtés de Max, mais se met en danger.

C'est une course contre la montre pour arrêter Basswood. Laura doit mettre sa réputation et sa vie en jeu si elle veut sauver les Synths, mais est-elle prête à abandonner sa famille et sa liberté? Niska a atteint la fin de son voyage, mais quand la source du mystère est révélée, son véritable voyage vient de commencer. Mia, Leo et Max sont côte à côte durant la bataille finale, mais vont-ils s'en sortir vivants? Quand le monde apprendra les atrocités qui se produisent, le sort des Synths changera-t-il pour toujours?