À la suite d'une guerre mondiale meurtrière, les gouvernements du globe ont réalisé qu'il était bien plus efficace d'entretenir quelques espions qu'une armée entière. Lily, malgré ses résultats scolaires plus que moyens, est recrutée par une de ces unités d'espion. Elle qui s'imagine côtoyer l'élite déchante rapidement lorsqu'elle est accueillie par d'autres dernières de classe et un professeur incapable d'enseigner…

L'entraînement spécial de l'Étincelle commence, mais Klaus balaie d'un revers de la main chacune de leurs tentatives. Le jour de la mission approche, Lily et ses nouvelles camarades seront-elles à la hauteur des attentes de Klaus ?

Le grand jour est enfin arrivé. L'Étincelle a atteint le laboratoire Endy et, comme prévu, la sécurité et à son maximum. Pendant que Klaus s'affaire à trouver l'échantillon du Pantin, Lily et ses amies doivent affronter un espion de l'empire. Leur mois d'entraînement aura-t-il été suffisant pour en venir à bout ?

De retour au manoir Mirage, Klaus se rend au cimetière pour y enterrer ce qu'il lui reste de son maître. Accompagné malgré lui par les huit autres membres de l'Étincelle, Klaus rend hommage à son ancienne équipe pendant que Lily se remémore comment Erna a fini par s'ouvrir à ses camarades…

Le cours continue et les défaites s'enchaînent pour l'Étincelle. Incapables de vaincre Klaus en travaillant en équipe, certains membres décident de partir en solo. De son côté, Lily repère ce qui pourrait bien être l'unique point faible de Klaus…

Après avoir inutilement sacrifié l'une de leurs camarades, l'Étincelle tombe sur une occasion en or de surpasser Klaus. Leur professeur doit se rendre en ville pour y récupérer des documents, un jeu d'enfant pour Sybilla et ses talents de pickpocket…

Un autre jour, un autre plan ambitieux pour vaincre Klaus ! À la différence qu'aujourd'hui, le plan de Lily et de ses amies pourrait bien détruire le manoir. Thea s'empresse de suggérer à l'équipe de se répartir les réparations, mais la proposition n'est pas au goût de tout le monde…

De retour de vacances après le succès de la mission impossible, Lily et ses collègues font face à un nouveau problème : l'état de fatigue évident de Klaus et son refus catégorique de se reposer sur elles.

Après avoir fait sa sélection, Klaus et les quatre membres de l'Étincelle s'en vont pour le manoir d'Uwe Appel, un politicien acariâtre pris pour cible par un assassin de l'Empire.

Après avoir essuyé une première tentative d'assassinat, le calme semble être revenu manoir. Cependant, l'Étincelle sait que Macchabée rôde toujours, et la soirée organisée par M. Appel pourrait bien être l'occasion qu'il cherche pour frapper à nouveau…

L'espion qui se terrait au manoir a enfin révélé son vrai visage. Grete semble avoir un plan, mais sera-t-il suffisant pour triompher sans l'aide de Klaus ?

L'Étincelle a finalement triomphé de Macchabée et de sa complice. Alors qu'elle rentre au manoir en compagnie de Klaus, Grete se remémore une opération menée peu de temps avant leurs vacances…

Les espionnes sont enfin de retour au manoir Mirage… enfin, la moitié d'entre elles. Thea, Erna, Monika et Annett ne répondent pas aux messages, et l'inquiétude monte. Klaus décide de lancer des recherches de toute urgence pour retrouver leurs camarades disparues.

Alors qu'elles profitent de leurs vacances, Thea et les membres de son équipe font la connaissance de Matilda Barbet, une technicienne de Lylat qui prétend être la mère d'Annett.

Thea et les autres ont fini par découvrir le secret de Matilda : elle est en réalité une espionne de l'empire. Alors que Monika conseille de suivre la loi et de la livrer à l'armée, Thea refuse de condamner la mère d'une de ses amies à un destin pire que la mort.

Alors qu'une partie de l'Étincelle se prépare à aider Matilda à s'échapper de Modero, Klaus et Lily se rapprochent dangereusement de la vérité concernant cette affaire.

Alors que les membres de l'Étincelle sont toutes de retour au manoir, Monika repense à sa petite mission pendant l'infiltration du laboratoire, et à son séjour à l'école d'espionnage.

Pendant que Thea et Grete ruminent leur dernier échec avec Klaus, l'amour frappe à la porte d'un autre membre de l'Étincelle…

Annett, rarement à court d'idées, se met en tête d'offrir un cadeau à Klaus. Pour ça, elle a besoin de fonds, et il s'avère justement que le leader de l'Étincelle a une mission à lui proposer.

L'Étincelle se dirige vers les États-Unis de Muzaia. Klaus, préférant agir seul, confie les rênes de l'équipe à Thea pour la durée de la mission, mais son manque d'assurance lui mine le moral.

L'opération bat son plein à Mitario, mais l'Étincelle n'a toujours aucune piste sur l'identité de Purple Ant. Pire encore, plusieurs espions opposés à l'empire ont été neutralisés, et Klaus craint que ses élèves soient les suivantes.

Monika semble avoir triomphé de Miranda, la joueuse de fléchettes, mais Sybilla est loin d'être sortie d'affaire. De leur côté, Grete et Thea s'inquiètent de la situation de Lily.

Thea, après avoir tenté le tout pour le tout, se retrouve entre les griffes de Purple Ant. Le souvenir de Hearth sera-t-il suffisant pour lui donner la force de triompher du roi de Mitario ?

De retour au manoir Mirage, la vie reprend son cours pour les membres de l'Étincelle... sauf une. Thea cherche à résoudre les énigmes laissées par le dernier message de Klaus, mais les réponses qu'elle trouvera seront-elles à son goût ?