Raphaël Balthazar, médecin légiste aussi charmant que déroutant, rejoint le capitaine Bach chez le juge Darrodeau et sa femme, violemment assassinés. Seule rescapée, leur fille, 6 ans, catatonique et incapable de parler. Quel drame intime s’est noué dans cette famille ?

Balthazar rejoint Chloé sur une scène de crime : un chantier sur lequel a été retrouvé le cadavre d'un ouvrier. La peau de son visage semble avoir été arrachée, ce qui le rend difficilement identifiable. En examinant le corps, le médecin légiste découvre que la victime a été tuée... ailleurs ! Elle portait une alliance qui lui a été retirée et ne travaillait pas dans la construction contrairement à ce que sa tenue pourrait laisser croire.

Une jeune femme est retrouvée morte dans un camion de congélation. La victime, qui était portée disparue depuis trois jours, a été agressée sexuellement.

Alors qu'il est au cinéma, Raphaël entend un hurlement. Une jeune femme est étendue dans le hall, le corps recouvert de sang. Le médecin légiste comprend vite qu'il ne s'agit pas du sien. Rapidement, il retrouve une autre victime, son fiancé.

Des morceaux humains sont repêchés dans la Seine, permettant de reconstituer partiellement un corps. Hélène Bach fait appel à Balthazar pour les examiner et l'aider à comprendre ce qu'il s'est passé. Il détermine que la victime est morte depuis au moins 36 heures. Il ne tarde pas à comprendre que les restes appartiennent en fait à deux cadavres. Il plonge dans le fleuve en quête des membres manquants.

Balthazar intervient en renfort sur la scène d'un accident de la route, venant en aide à un conducteur blessé. En fouillant les environs, il découvre le corps d'une jeune femme. Un premier examen lui permet de déterminer qu'elle était déjà morte au moment du drame. Toute indique qu'elle se trouvait dans le coffre de l'un des véhicules impliqués et a été éjectée.

Scène de crime insolite dans une aire de jeu : un chien mort, criblé de coups de ciseaux entre les toboggans et les balançoires. Mais le pire reste à venir : la mare de sang à côté du chien vient d’un être humain, et sous l’animal, on découvre un doudou. Celui d’un bébé.

Dans une abbaye abandonnée, un sac d’os est déterré lors d’un chantier. A première vue, il s’agit d’ossements issus d’une fosse commune du Moyen Âge. Problème : d’après Balthazar, parmi ces os, ceux d’un jeune homme de 20 ans, Arthur, disparu d’un village des Yvelines il y a dix jours.

Un homme et une femme ont été attaqués au couteau à leur domicile en pleine nuit. Seule l'épouse a survécu. Le mode opératoire du criminel rappelle celui d'un tueur emprisonné depuis plusieurs années.

Une jeune femme est retrouvée pendue, en sous-vêtements, sous un pont parisien. Balthazar informe le capitaine Bach et Delgado qu'une autre victime s'est tuée de la même manière quelques jours plus tôt.

Balthazar se réjouit de ses nouvelles relations avec sa jeune voisine. Alors qu’il lui a préparé un petit déjeuner au lit, il est appelé sur une affaire. Suite à un coup de fil anonyme, la police a retrouvé le cadavre d’un homme dans un magasin de jouets. Le médecin légiste détermine rapidement que la victime a succombé à un virus qui lui a été inoculé. Balthazar ordonne la mise en quarantaine de la scène de crime, une policière ayant également été contaminée. L’armée est envoyée sur place. A la capitaine Bach, Balthazar prétend que tout va bien. Mais il est inquiet.

A l’occasion d’une remise de médaille, Balthazar présente Maya à ses collègues et notamment à Hélène, qui est troublée de voir le légiste si heureux. Durant la cérémonie, Bach est contactée pour une urgence. Lola, 18 ans, appelle à l’aide alors qu’elle est en train de se faire agresser et enlever dans sa voiture. Dans le coffre de la victime, Balthazar trouve des serpents... Les policiers finissent par découvrir que Lola avait été le témoin-clé d’un incendie criminel, pour lequel un homme a été arrêté. Mais ce dernier est poignardé en prison et meurt dans les bras de Bach.

Le cadavre d'une femme âgée d'une quarantaine d'années est retrouvé sur une péniche de transport fluvial. La victime porte un costume de Blanche-Neige. D'après les premières constatations, Balthazar peut affirmer qu'elle a été tuée par une balle de fusil de chasse. Sa fille affirme que sa mère avait l'obsession de partir en Australie pour retrouver son fils. Rapidement, l'affaire se complexifie.

Hélène et Balthazar sont encore sous le choc de ce qu'ils viennent de découvrir dans l'enquête sur la mort de Lise. Mais ils sont bientôt appelés sur une autre enquête. Trois jeunes campeurs ont été sauvagement assassinés en forêt. L'enquêtrice et le médecin légiste s'interrogent sur les raisons qui ont pu déclencher un tel déferlement de violence. Une vidéo est retrouvée sur le portable de l'une des victimes.

Devant la PJ, Hélène a la surprise de retrouver Cat Meyer, son amie et ancienne chef de groupe à Valence. Celle-ci est à Paris pour témoigner dans un procès d'assises. Quelques heures, plus tard, la policière est retrouvée morte dans un bois. Hélène est dévastée. Mais elle décide d'en savoir plus sur l'affaire dans laquelle Cat allait témoigner. Dans le même temps, le tueur de Lise se rapproche. Peu à peu, Balthazar perd pied.

Un jeune homme se présente au commissariat ensanglanté et avec le scalp d'une femme âgée sur la tête. Balthazar comprend qu'il vient d'un hôpital psychiatrique. Mais l'identité de la victime n'est pas établie. Quelques heures plus tard, quatre personnes sont retrouvées mortes à leur domicile. Toutes ont été scalpées. Parallèlement à cette affaire, Raphaël s'enfonce peu à peu dans la folie.

Balthazar parcourt les océans en voilier depuis six mois pour oublier les événements tragiques de l’année précédente... Accostant sur une île paradisiaque, il décide d’amarrer pour la nuit. Mais un cadavre carbonisé tape contre la coque. Balthazar, malgré ses réticences, examine le corps… quand il est rejoint par Hélène, qui le cherche depuis sa disparition.

Mauvaise journée en cette veille de vendredi 13. Alors que Balthazar s’apprête à rejoindre Hélène pour analyser le corps de Nabil, un jeune homme jeté du 6ème étage, il doit porter secours à une femme au visage ensanglanté qui vient de se faire violemment agresser devant l’IML. Rapidement, l’affaire se complexifie. Aucune trace de l’agression de cette femme et ses blessures ne correspondent pas à ses déclarations. Pourquoi voulait-elle à tout prix entrer dans l’IML ?

La voiture de Balthazar roule à tombeau ouvert, Hélène et Balthazar à l'intérieur. Poursuivis par l’armée, ils sont rattrapés, arrêtés, et contraints d'ouvrir le coffre, à l'intérieur duquel se trouve le corps d'un homme qui s'est pris une balle dans le ventre. Une balle tirée par le pistolet du capitaine Bach. Comment en sont-ils arrivés là ? Sommés de s'expliquer par la police des polices, Balthazar et Hélène racontent les 48H qui les ont conduits à cette situation.

Le corps d’Anna, mère de famille, est retrouvé dans une chapelle, roué de coups. Dans son sac à main, un ADN qui relie sa mort à celle de deux autres femmes sur les douze derniers mois. Ces femmes ont-elles été victimes d’un tueur en série ? Balthazar réalise qu’Anna pratiquait le "free fight" dans des combats clandestins. Grâce à lui, Hélène et Delgado arrêtent l’assassin d’Anna, une autre combattante qu’elle venait d’humilier dans l’arène. Mais elle nie avoir tué les autres femmes. Effectivement, l’ADN ne colle pas…

Meurtre sauvage dans une forêt. Un homme et une femme, les bras en croix, des pièces posées sur leurs yeux. L’homme est un braqueur multirécidiviste et la femme n’est autre que son médium. C’est visiblement elle qui était visée. Depuis quelques temps, elle était obsédée par une fillette atteinte d’une maladie incurable, venue la voir pour savoir ce que cela fait de mourir. En discutant avec le fantôme de Marion, Balthazar comprend que la mort de Lise l’empêche d’avancer. Lorsqu’il se réveille le lendemain, Balthazar est… marié à Lise, parfaitement vivante. Ils ont deux enfants et lui n’est qu’un légiste ordinaire qu’Hélène prend pour un rigolo.

Balthazar et Hélène sont à la recherche d’un garçon d’une dizaine d'années ayant disparu après avoir été aperçu le visage ensanglanté dans un entrepôt. Ils remontent jusqu’à son domicile où ils découvrent sa mère, égorgée. En enquêtant, ils apprennent que l’enfant - contrairement à ce qu’elle prétendait à tous les voisins - n’était pas son fils.

Le corps d’un homme ayant disparu alors qu’il promenait son chien est retrouvé flottant dans une piscine recouverte de ballons. L’enquête révèle qu’il s’agirait de l’œuvre d’un clown, qui a mis en ligne des vidéos du meurtre pour narguer la police. Peu à peu, Balthazar et Hélène découvrent que le suspect est un véritable psychopathe qui a fait manger son propre toutou à la victime et dont le comportement semble difficilement prévisible.

Alors qu’il est en chemin pour le palais de justice, Janvier parvient à s’échapper. Une véritable course contre la montre s’engage alors pour Balthazar et Hélène, qui doivent à tout prix le retrouver avant qu’il ne fasse une nouvelle victime. Une situation particulièrement délicate pour le médecin légiste, qui s’apprête à vivre... le jour le plus heureux de sa vie en épousant Maya.

Balthazar s'amuse comme un petit fou, à moitié ivre, sur un circuit de conduite sur glace après un week-end de fête ; l'une de ces fêtes qu'il enchaîne depuis l'arrestation de Maya et le départ d'Hélène sept mois plus tôt. Mais il doit filer, son avion l'attend. Après le décollage, il rassure sa voisine enceinte, Julia, quand un passager est pris de convulsions. Rapidement, il diagnostique un empoisonnement et sa vie est en jeu. Avec les moyens du bord et l'aide d'une infirmière, Camille, il stabilise le malade quand le copilote et une demi-douzaine de passagers sont à leur tour pris des mêmes violentes convulsions. Ils ont été empoisonnés. Et le tueur est dans l'avion.

Alors que Balthazar détourne les questions de son psychologue, qui veut le faire parler de la nuit tragique de son mariage, il reçoit un appel. Un chien a ramené une étrange trouvaille à son maître : un pied humain. Balthazar rejoint Delgado et Camille, la nouvelle capitaine. Et son premier examen calme tout le monde : le pied a été découpé sur un homme encore vivant... Après autopsie de ce pied, Balthazar parvient à dresser un portrait-robot de la victime. Et Camille l'identifie. Ils se précipitent chez elle mais arrivent trop tard. L'homme a été massacré après qu'on lui a tranché le pied. Camille reçoit un appel : une deuxième victime vient d'être signalée, à laquelle on a coupé la tête.

Anaïs, 6 ans, est enlevée. Qui a pu s'en prendre à l'enfant ? Ce pédophile récemment sorti de prison ? Le pion du lycée de la sœur d'Anaïs qui l'a récemment éconduit ? Mais alors que les événements s'accélèrent et que l'arrestation du suspect connaît une issue tragique, Raphaël et Camille comprennent que la vérité est pire que tout ce qu'ils avaient pu imaginer.

Suite aux frasques de Raphaël, la froide Docteure Vésinet débarque pour l'évaluer. En parallèle, dans une casse, trois jeunes ont été massacrés. Le principal suspect est un homme dont les jeunes avaient cambriolé la maison. Mais pourquoi les aurait-il massacrés pour des babioles ? A moins que ces babioles renferment un terrible secret. Raphaël est prêt à tout, y compris braver la loi, pour arrêter ce dangereux psychopathe.

Balthazar, qui fait tout pour éviter le docteur Vésinet, donne un cours à la fac de médecine en compagnie d'Eddy et Fatim lorsqu'il est pris en otage par l'un de ses élèves, William. Le jeune homme souhaite innocenter son père, incarcéré pour le meurtre de sa mère, et exige de Balthazar qu'il étudie le dossier. Alors que Camille, Olivia et Delgado suivent la situation avec le RAID et la sœur de William depuis le couloir de la fac, Balthazar tente de raisonner le jeune garçon, qui finit par lâcher son arme. Mais il l'interrompt au dernier moment : il y a bien quelque chose qui cloche dans le rapport d'autopsie. Le père de William a-t-il réellement tué sa mère, conformément à ses aveux ?

Une équipe de documentaristes intègre l'IML pour tourner un reportage alors qu'Eddy et Fatim ne s'adressent plus la parole et que la guerre est déclarée entre Olivia et Balthazar. Alors que chacun tente d'instrumentaliser la présence des journalistes pour régler ses comptes, un squelette est découvert, celui d'un homme tué à coups de pierres et dont le corps a été bouilli. Les légistes vont tenter de découvrir quel est le lien entre la victime et une expédition de spéléologie ayant eu lieu deux ans plus tôt.

Le conflit s'envenime entre Vésinet et Balthazar. Et lorsqu'elle l'envoie sur une sombre affaire de vaches assassinées dans un village qu'il déteste, la tension monte encore d'un cran. Heureusement, Camille est là pour accompagner le légiste dans cette épreuve. En effet, c'est dans cette commune que Balthazar a grandi avant de fuir vingt ans auparavant. Alors reprend contact avec son passé, ses parents, ses mauvais souvenirs et qu'il introduit Camille au monde de son enfance, Balthazar doit aussi affronter la mort de son amie Sabrina, gendarme, a priori victime du même tueur que celui qui s'attaque aux vaches

Balthazar est inculpé pour double homicide. Il est en cellule, dévasté, menottes aux poignets. Est-il ce monstre qu'on lui décrit ? Et quels sont ces souvenirs qui continuent de le hanter ? Ne serait-on pas en train de le manipuler ? Personne ne peut lui donner les réponses qu'il cherche et Balthazar n'a pas le choix. Pour comprendre ce qui lui arrive et qui le persécute, il doit s'évader et devenir un fugitif. Pour Camille, cette évasion est une trahison. Et elle décide, coûte que coûte, de le retrouver.

Marrakech. Balthazar coule des jours heureux, loin de la police qui le traque, encore convaincue de sa responsabilité dans les meurtres perpétrés par son frère. Mais la quiétude de Balthazar vole en éclats quand il apprend que Camille, Delgado et Olivia ont perdu leur poste à cause de l’aide qu’ils lui ont apportée lors de sa fuite et de leur échec à arrêter un criminel sanguinaire qui sévit à Paris, "Le marionnettiste".

Balthazar est coincé chez lui avec un bracelet électronique à la cheville. En attendant la décision des juges, il épie ses voisins pour combler son ennui. Soudain, il voit Arthur, 17 ans, un masque de canard sur le visage, se pendre dans sa chambre et se précipite pour le sauver. Au même moment, à Paris, un cauchemar fait irruption : une silhouette au masque de canard tue trois passants au hasard.

Balthazar est de retour à l'IML... avec sa fille Alice qu'il a sur les bras 48H le temps qu'elle soit placée. Pour se refaire la main, il autopsie une vieille dame, mais en l'ouvrant avec Eddy, Fatim et Olivia, il découvre... une bombe. Dans 10 minutes, elle explose. Heureusement Balthazar, conseillé à distance par Camille, la désamorce in extremis.

Alors que Balthazar tente de remplir son rôle de père pour Alice, mais aussi de gérer la nuit passée avec Olivia, il est appelé sur une drôle d'affaire. Un car de retraités a été retrouvé vide dans un champ, les 6 personnes âgées se sont volatilisées. Le chauffeur parle d'une grande lumière blanche et dans le champ, les enquêteurs découvrent un immense crop circle. Des extraterrestres ?

Balthazar et Camille sont appelés sur une impressionnante scène de crime : une famille, le père, la mère et le fils, ont été exécutés sur une aire d'autoroute. Rapidement Balthazar comprend que la famille a été créée de toutes pièces : aucun d'entre eux ne se connaissait quelques jours avant de monter dans cette voiture. Chacune des victimes a accepté cette mascarade pour transporter de la drogue... qui a disparu. Qui les a tués et a volé la drogue ?

Camille apprend que Maya vient de s’évader de prison grâce à Alexandre. Le duo infernal est de retour. Que veulent-ils ? S’en prendre à Alice ? Mais alors que Balthazar s’effondre d’inquiétude, Camille se réveille... dans un cercueil. Six pieds sous terre