Le jour de la rentrée à Alan Turing, un lycée technologique novateur, Austin, Parker, Tamra et Trey découvrent qu'ils forment la nouvelle génération de Cyber-gardiens.

Alors que Vera s'adapte à son existence d'ado virtuelle, le Hacker ranime un vieil ennemi, progressant ainsi dans sa mission de destruction.

Parker s'accorde une mise à jour non autorisée. Mégabyte prend le contrôle d'une forteresse numérique et entame la construction d'une armée de sentinelles.

Mégabyte crée la diversion avec un adorable chat contenant un virus, tandis que le Hacker se prépare à lancer une attaque de plus grande envergure.

Le décryptage d'une curieuse sphère révèle les surprenantes origines du code des gardiens. Austin et Parker partent alors à la recherche d'autres sphères.

era intègre à son système un plug-in d'émotions d'adolescent. Elle enchaîne alors les sautes d'humeur et met une importante mission en péril.

Quand Mégabyte et ses sbires attaquent Virusylum, Trey doit faire un choix difficile : continuer le sport ou sauver la planète.

Vera convainc la mère d'Austin que la technologie peut rendre sa vie meilleure. Mais un virus transforme Alyx, son assistante virtuelle, en un être diabolique.

Les Gardiens unissent leurs forces pour empêcher le Hacker de dévaster la côte ouest avec un satellite météo. La mère d'Austin fréquente quelqu'un !

Mégabyte s'allie à sa méchante sœur Hexadécimal, et les Gardiens font la rencontre des personnages d'origine de ReBoot.

Lorsque Sourceror pirate le réseau Dyna-Cell, Hexadecimal l'accompagne et finit par compromettre la mission de Megabyte. Pendant ce temps, Vera découvre que le Sourceror est à la recherche des identités des Gardiens, maintenant qu'il sait qu'elles sont humaines. Les Gardiens capturent Hexadecimal et l'envoient à Virusylum. Ils découvrent que le DIS est lié au passé d'Adam Carter et que les sphères contiennent les souvenirs d'Adam concernant le Code des gardiens.

Sourceror prévoit de créer un botnet et de lancer une attaque par déni de service géante et distribuée . Pendant ce temps, Parker et Austin découvrent que le petit ami de Judy, Rowan, travaille pour le département de la sécurité Internet et que l’agent Nance du DIS avait menacé Adam un an auparavant. Après la défaite de Sourceror, Rowan donne aux Guardians un lecteur flash contenant les recherches restantes de l'ordinateur d'Adam. Après avoir trouvé un dispositif de surveillance dessus, ils décident de ne pas faire confiance au DIS.

Pour prouver sa valeur au Sourceror au milieu des menaces constantes de suppression, Megabyte infecte une gamme de jouets pour abeilles afin de faire peur aux enfants du monde entier. Après que les Guardians l'aient arrêté, le Sourcerer a appris leur identité et a demandé à Megabyte de les capturer et d'accéder à leur technologie.

Lorsque Tamra télécharge accidentellement un enregistrement vidéo de Vera frappant à propos d'elle-même et des Guardians, sa camarade de classe Shari le télécharge et le partage à son insu, ce qui l'amène à se renseigner sur des informations sensibles. les Gardiens parviennent à intercepter la vidéo avant que quiconque ne la voie. Parker apprend que les "rendez-vous" de Vera avec Trey devaient vraiment l'aider à étudier. Au siège du DIS, l'agent Nance reconnaît le Code du gardien comme étant le travail d'Adam et elle est résolue à trouver les gardiens et à prendre leur technologie par la force.

Rowan a appris l'identité des Gardiens, mais refuse la connaissance des autres agents du DIS. Il s'approche des adolescents et leur demande de l'aide pour empêcher le Sourceror de lancer une frappe de missile nucléaire utilisant des ordinateurs DIS.

Alors que Tamra est absente de l'école, Shari découvre la base secrète des Gardiens dans le sous-sol de l'école. confondant cela avec un club de jeu de réalité virtuelle , elle entre dans le cyberespace en tant qu'avatar du gardien de Tamra Enigma. Les autres Gardiens la suivent, mais Megabyte les capture tous et ils rencontrent finalement le Sourceror, qui extrait des données de l'avatar de Shari. Vera envoie Tamra comme une sauvegarde d'Enigma et de ses cinq évadés, tandis que Megabyte trompe le Sourcerer et se libère. Vera efface les souvenirs de Shari de l'épisode, pendant que le Sourceror découvre leur emplacement.

Désormais libéré de la menace à la vie de Sourceror, Megabyte tente de détourner tous les médias sociaux du monde, effrayant les utilisateurs lorsqu'il commence à leur parler. Avant que les Gardiens ne puissent adopter un plan, l'agent Nance envoie les disques DIS sur eux et capture un mégaoctet. Cependant, lorsqu'il est dans Virusylum, Hexadecimal lui offre une chance de vengeance en se basant sur les connaissances acquises depuis l'épisode 11; il accepte à contrecœur. The Sourcerer entame un voyage physique au lycée Alan Turing.

Les sentinelles de Megabyte le dissuadent ainsi que Hexadecimal de Virusylum. Avant que les Gardiens ne puissent adopter un plan, les drones du DIS les interceptent afin que Nance puisse vérifier si les Gardiens sont des humains à l'aide du Code de gardien d'Adam. À la fin de l'épisode, le Sourcerer arrive à l'école après les heures normales de travail et entre par effraction.

Le Sourcerer découvre la base secrète des Guardians et Austin le reconnaît comme étant Adam, qui aurait péri dans un incendie. Nance fait enlever le DIS à Austin après l'école, mais Rowan le libère secrètement, juste à temps pour rejoindre les autres Gardiens dans la lutte contre les pirates du vol d'identité . Ils découvrent une sphère de mémoire révélant qu'Adam avait simulé sa mort pour protéger sa famille de l'agent Nance, puis pénétraient dans le cyberespace pour étudier le code obscur pendant un an. En fin de compte, ils apprennent que le code sombre l’a attaqué et l’a infecté, lui donnant une autre personnalité que le Sourcerer.

The Sourcerer utilise les sentiments d'Austin envers son père pour accéder à leur base secrète, d'où il entre dans le cyberespace et tente de détruire Internet. Adam se bat pour le contrôle alors que le Sourcerer se bat contre les Gardiens, et Adam finit par sacrifier sa vie pour les sauver et protéger Internet. Austin pense qu'il a une chance de survivre. Megabyte et Hexadecimal reviennent dans la forteresse de Megabyte avec une armée plus nombreuse que jamais.