Arisu et ses amis se précipitent dans des toilettes publiques pour se cacher de la police. Lorsqu'ils en ressortent, les rues de Tokyo sont vides.

Laissant Chota qui est blessé, Arisu et Karube cherchent à engranger de l'expérience. Ils arrivent ainsi dans un immense appartement où ils doivent jouer au loup.

Les visas de Chota et de Shibuki expirant bientôt, le quatuor pénètre dans un vaste jardin botanique à Shinjuku, où il participe à un jeu de trahison.

Submergé par la culpabilité, Arisu est prêt à tout abandonner, mais Usagi l'exhorte à se ressaisir. Un jeu d'endurance sur une autoroute souterraine les attend à présent.

Arisu et Usagi ayant trouvé le chemin de la Plage, le roi du soi-disant havre utopique les oblige à lui venir en aide pour rassembler les cartes restantes.

Chishiya recrute Arisu et Usagi pour qu'ils l'aident à bousculer l'ordre établi. Un événement imprévu bouleverse les fragiles rapports de force à la Plage.

Ancien sanctuaire, la Plage devient l'arène du prochain niveau, où une chasse aux sorcières monte les joueurs les uns contre les autres dans un ultime affrontement.

Les tensions sont à leur comble. Tandis que le chronomètre s'approche de zéro, ceux qui ont survécu à l'attaque affrontent à présent un futur incertain.

Inquiets, Arisu, Usagi, Kuina et Chishiya patientent depuis plus d'une heure au carrefour de Shibuya en attendant le début de la prochaine étape, mais rien ne se passe.

Maintenant que le Roi de trèfle s'est révélé dans toute sa superbe, le jeu commence enfin. Et au grand étonnement d'Arisu, les choses se passent plutôt bien.

À quelques minutes de la fin du jeu, alors que les scores de chaque équipe semblent arrêtés, Arisu va trouver Kyuma et demande à lui serrer la main.

Alors qu'il ne reste plus que quelques participants, Chishiya est sans partenaire. La prochaine partie pourrait bien être la dernière du jeu.

Aguni n'a qu'une idée en tête : retrouver et tuer le Roi de pique. Il est accompagné dans sa quête d'Arisu et d'une lycéenne déterminée nommée Akane Heiya.

Usagi devra rallier les joueurs sceptiques qui composent l'équipe de la Reine. Au Palais de justice, Chishiya rencontre le Roi de carreau.

Au cœur d'un Shibuya Crossing où la nature a repris ses droits, Niragi défie Arisu et Chishiya. Mais arrive alors le Roi de pique...

Pour leur ultime jeu, ils devront survivre à trois manches de croquet. Mais à peine ont-ils entamé la partie, que la Reine les invite à prendre le thé.

De retour dans le monde réel sans aucun souvenir de Borderland, Arisu et Usagi rencontrent Ryuji, un professeur obsédé par les expériences de mort imminente.

Le premier jeu se déroule dans un sanctuaire. Arisu et les autres joueurs doivent résoudre des problèmes mathématiques de tête avant que tout s'embrase.

Le plan de Rei échoue. Arisu prend une décision risquée pour maintenir son équipe en vie. Dans un autre jeu, Usagi et Ryuji doivent esquiver des rayons laser.

Pour ne pas succomber à un accident imminent, le groupe d'Usagi doit sauter d'un train à l'autre. Un jeu de canettes explosives attend l'équipe d'Arisu.

Arisu suit son double numérique dans une simulation du Shibuya du futur. En chemin, il s'arrête devant une scène réconfortante... et se retrouve face à la vraie Usagi.

Hanté par un aperçu désespérant du futur, Arisu, qui voudrait sauver tout le monde, croule sous la pression. Arisu, Usagi et l'équipe parviendront-ils à trouver la sortie ?