Les chefs de deux clans de guerriers ninja, Iga et Kouga, sont convoqués à Sunpu pour lancer une importante compétition entre les deux.

Oboro et Gennosuke ont un rendez-vous. La lutte entre les deux clans commence en essayant d'obtenir la "copie Iga" du document qui révèle les détails du tournoi des Ninja.

Le drame s'intensifie alors que le clan Iga tente de déjouer ses adversaires en attaquant à la fois Kazamachi Shôgen, qui possède la copie du parchemin.

Un agréable dîner a lieu avant que d'autres Iga n'entendent parler de la guerre.

Les Kouga commencent à s'inquiéter de l'absence de Gennosuke, et des mesures sont prises pour étudier la configuration du terrain.

Lors de leur voyage de retour vers les exploitations du clan Iga, des primes inattendues sont découvertes dans la nature.

Gennosuke se méfie à mesure que l'hostilité augmente, tandis que l'autre captif Kouga prend des décisions désastreuses.

Le temps est venu de s'endurcir le cœur, de mettre l'espoir de côté. Les frères et soeurs cherchent à se réunir.

Avec le parchemin secret désormais en possession de Gennosuke, la tromperie élaborée par les Iga prend fin.

Lord Ieyasu et les nobles passent en revue le carnage à distance, comptant les morts après seulement deux jours depuis la rupture de la paix.

La roue du destin a commencé à tourner, alors que l'histoire semble se répéter. Appelée à rester unie à son clan, contre les Kouga et son bien-aimé Gennosuke, Oboro sacrifie leur arme la plus précieuse.

Lorsque le défi lancé par Gennosuke est accepté, les deux clans prennent la route. Mais la trahison et la mort les suivent.

Les amants se retrouvent à l'ombre dans la nuit, alors que les coups de la guerre se poursuivent sans relâche.

Les mots du passé hantent Gennosuke, et Oboro est convaincu que sa vie se terminera entre ses mains.

La haine du passé pousse à l'imprudence, et lorsque deux ennemis sont pris au piège, l'un ne peut pas échapper à l'autre.

A une époque plus simple, bien avant les machinations politiques et la dissolution du pacte de non hostilité, un plan a été mis en place pour assurer une paix durable entre les Kouga et les Iga.

Les Kouga se pressent vers le château de Sunpu. Une fausse direction sous la forme d'un faucon et un affrontement dans la nuit révèlent les véritables intentions de Gennosuke.

La mort se tient sur le chemin des Kouga, attendant avec un souffle appâté, silencieuse dans la brise de la nuit. Le sacrifice du mentor assure la survie de l'élève.

De fausses voix dans la nuit jouent au mensonge et à la tromperie, conduisant une personne aveugle à une mort inévitable.

Sur les rives d'un fleuve, un laissé pour mort est de nouveau ressuscité. Ayant enfin appris la vérité qu'il cherchait à découvrir, Gennosuke est résigné face à cette guerre qui n'a jamais été la leur.

Le secret de Tenzen est enfin révélé, et prouve la mort d'un Kouga déguisé. Alors que les forces de Lady Ofuku apportent force et protection aux deux survivants d'Iga, ils continuent leur chemin vers le château de Sunpu.

Avec Kagero en captivité, Oboro lance un défi public, cherchant à faire sortir Gennosuke pour l'affronter une dernière fois.

Gennosuke coupe enfin le serpent, celui qui a alimenté l'inimitié entre les Kouga et les Iga pendant deux siècles.

Ramenés sur les lieux mêmes où tout a commencé, Gennosuke et Oboro s'affrontent sur le champ de bataille.

Dix ans après que les clans Kôga et Iga se sont déchirés pour une bataille de succession, les ninjas ne sont plus dans l’air du temps. Néanmoins, un nouveau complot se trame, et les premiers concernés seront Hachirô Kôga et Hibiki Iga…

Cinq guerriers de Kôga viennent assurer la défense du seigneur Tadanaga dans sa quête périlleuse. Par ailleurs, Hachirô décide de quitter son village par peur de blesser les autres avec son pouvoir, mais sa sœur Hibiki ne l’entendra pas de cette oreille.

Les cinq joyaux de Kôga tombent les uns après les autres face à un ennemi inconnu. La priorité est donnée, il faut protéger Hachirô, qui heureusement est loin du fleuve où se déroule le massacre.

Les membres de la secte de Jôjin ont enfin approché le seigneur Suruga et entament leur plan. Pendant ce temps, après les joyaux de Kôga, c’est au tour des cinq fleurs d’Iga d’être la cible de ce nouvel ennemi.

La secte de Jôjin continue son attaque. Cette fois, les camarades de Hibiki et Hachirô en feront les frais face à un monstre gigantesque. Mais pour le chef de Kôga, il est hors de question de rester les bras croisés !

Des années sont passées, le shogun a changé. Un incident a assigné le seigneur Tadanaga à demeure. Pendant ce temps, les membres des clans Kôga et Iga ont bien grandi, et tous se demandent si Hachirô reviendra un jour.

Le seigneur Tadanaga souhaite s’entretenir avec Hachirô pour lui exposer ses plans. Au château d’Edo, Namenba s’est infiltrée pour savoir si le shogun est lié aux affaires des Houes noires et de la secte de Jôjin.

Pendant qu’Utsutsu et Rui vont enquêter au secret au mystérieux château de nuage, Hachirô, aidé sans même le savoir ni le vouloir par ses anciens compagnons, évite les pièges des hommes du seigneur Suruga.

Jôjin revient à la charge auprès du seigneur Tadanaga pour lui rappeler quelles ambitions il peut viser. Au château de nuage, Rui et Utsutsu tentent tant bien que mal d’échapper aux hommes de la Pluie.

Armées jusqu’aux dents, les troupes de la province de Kii s’attaquent au château de nuage, où a trouvé refuge le seigneur Tadanaga. Bô Hadae, le moine à la botte de Tenkai, va demander l’aide des clans Iga et Kôga pour affronter la secte de Jôjin.

Shikibu en impose par sa carrure titanesque. Mais qui se cache réellement derrière son armure ? De mystérieux assaillants s’en prennent aux Kôga et aux Iga, et Hachisu sera chargée de les arrêter.

Hibiki annonce au groupe que Hachirô est revenu. Tous s’apprêtent à lancer l’offensive sur le Nuage. Pendant le combat, Shichigen se souvient du temps où il voyageait avec sa mère, et du poème qu’elle aimait tant réciter.

C’est au tour de Saizô et Utsutsu de passer à l’attaque. Toutefois, la Pluie est toujours présente. Utsutsu maîtrise ses illusions à la perfection, mais celles-ci sont si sombres qu’elles ne peuvent que ronger intérieurement la jeune femme…

Jôjin prend au dépourvu Hachirô et Bô Hadae. Mais l’objectif du leader de la secte n’est plus d’éliminer le chef des Kôga, bien au contraire… Plus tard, Bô Hadae va tenter de raisonner le seigneur Suruga.

Bien que le Nuage ait brûlé puis disparu, suivi de la secte de Jôjin, Gorone reste persuadé que l’ennemi est toujours présent. En même temps, Hachirô mène sa propre enquête et croit savoir ce que la secte ennemie a derrière la tête.

Un nouveau Nuage fait son apparition, et cette fois, il peut se mouvoir… Le seigneur Tadanaga a déjà hâte de se diriger vers Edo. De plus, Hibiki est à son tour sous le contrôle de Jôjin et rejoint aussi ce château…

Le Nuage avance toujours. D’un côté, Hachirô continue de faire face à Itaru Yasha de Jôjin. D’un autre, Bô Hadae infiltre le château pour raisonner le seigneur Tadanaga. Namenba, quant à elle, se souvient sa rencontre avec Rui.

L’esprit du seigneur Tadanaga est de nouveau semé par le doute. Jôjin empêchera coûte que coûte Bô Hadae de repartir avec le frère du shogun. Plus loin, Hachirô est déterminé à aller secourir Hibiki dans le Nuage.

Hachirô entre dans le Nuage. Suite à la perte de Gorone, les autres membres décident d’aider leur chef à sauver Hibiki. Les yeux de Saizô feront rapidement face à Itaru et son miroir maléfique…

Les sacrifices de Gorone et Saizô n’auront pas été vains. Les Kôga et les Iga parviennent à infiltrer le Nuage. Au même moment, Hachirô est obligé d’affronter Hibiki, qui pense être Oboro des Iga et répond aux ordres de Jôjin.

Dans le Nuage, Rui et Utsutsu font face à Chiô Neiri, qui n’a pas succombé à l’attaque de Gorone. Shichigen est, quant à lui, toujours sous l’emprise de l’ennemi. Plus haut, Jôjin veut obliger Hachirô et Hibiki à copuler.

Bô Hadae vient épauler Hachirô et Hibiki, qui a enfin retrouvé ses esprits. Jôjin ne perd pas de vue l’idée de verser le sang des deux chefs de clan pour ressusciter Nobunaga Oda, le roi des démons.

Le seigneur Nobunaga Oda est revenu à la vie… Hachirô n’a d’autre choix que d’essayer d’achever ce nouvel ennemi assoiffé de vengeance et de pouvoir. Néanmoins, un tel monstre ne sera pas facile à éliminer.

Hachirô et Hibiki, transportés dans une autre dimension, font face à la secte de Jôjin aux portes de la victoire. Les deux ninjas sauront comment régler le compte à leurs adversaires et comprendront qui est vraiment le seigneur Jôjin.