Six mois après leur tour du monde, Philéas Fogg et ses amis se remémorent leur aventure. L'arrivée du professeur Lidenbrock va cependant les entraîner dans une toute nouvelle aventure suite à la découverte d'un parchemin mystérieux.

Le voyage pour le centre de la Terre commence. Philéas et ses amis prennent le train pour Hambourg mais ils ignorent que Sullivan a chargé son acolyte Transfert de leur mettre des bâtons dans les roues.

Arrivés à Copenhague, Philéas et ses amis trouvent rapidement un navire pour l'Islande. Pour patienter en attendant que leur bateau soit prêt, Philéas, Lidenbrock et Tico, partent visiter la ville. Pendant ce temps Transfert prépare un nouveau piège.

Après avoir traversé la mer du nord, Philéas, Passepartout et Lidenbrock font route vers le volcan Sneffels accompagnés de leur mystérieux guide Hans. Le trajet ne s'annonce pas de tout repos.

Philéas et ses amis continuent l'ascension du volcan qui se révèle de plus en plus périlleuse. De son côté, Transfert prépare encore un sale coup avec l'aide de deux malfrats.

Transfert a capturé la princesse Romi et Tico et les emmène rejoindre Philéas pour l'obliger à mettre fin à son périple. Arrivés au sommet, Philéas, Passepartout et le professeur doivent maintenant descendre dans la cheminée du volcan.

Transfert repart pour Londres afin d'informer Sullivan de la situation. Pendant ce temps, le groupe de Philéas enfin au grand complet, entame la descente vers le centre de la Terre. Bien des dangers les y attendent.

À Londres, Transfert et Sullivan se réjouissent à la perspective de l'échec de Philéas. En effet, le groupe n'a que très peu d'eau potable à cause d'une fourberie de Transfert. Arrivant au bout de leurs réserves, l'expédition doit impérativement trouver de l'eau potable.

Après avoir résolu leur problème d'eau, l'expédition de Philéas et du professeur Lidenbrock continue. Confrontés à des effondrements dans les galeries souterraines, ils auront fort à faire pour pouvoir continuer leur progression.

Séparés du groupe, la princesse Romi et Tico essaient de retrouver leurs amis. De leur côté, alors que Philéas et les autres mènent leurs recherches pour retrouver les deux disparus, Hans fait une découverte incroyable par accident.

Le groupe de Philéas confectionne un radeau pour traverser la mer souterraine. Après la découverte d'une preuve du passage de Saknussemm et un moment de détente, il est temps de poursuivre le voyage à bord du radeau.

Le volcan va entrer en éruption. La situation se complique dangereusement pour l'expédition de Philéas. La mer souterraine se déchaîne, c'est une véritable tempête que doivent affronter les aventuriers.

Avec le journal d'Arn Saknussemm en main, Philéas détient la preuve dont il a besoin pour gagner son pari. Il ne lui reste plus qu'à rejoindre Londres à temps avec ses amis. Malheureusement le voyage de retour risque d'être lui aussi mouvementé.

À peine revenu de son voyage au centre de la Terre, Philéas Fogg se voit proposer une nouvelle aventure par le gouvernement américain qui sollicite son aide pour résoudre le mystère qui se cache derrière une série de naufrages.

Philéas et ses amis ont embarqué pour l'Amérique. À bord, ils tombent sur une vieille connaissance, une occasion parfaite de se remémorer le passé. C'est également l'anniversaire de la princesse Romi.

À bord de l'Abraham Lincoln, Philéas fait la connaissance du professeur Aronnax, un expert en créatures marines, et de Ned le harponneur. Ralph et Tico découvrent la cachette d'un passager clandestin.

Partis depuis plusieurs semaines, Philéas et ses amis n'ont encore trouvé aucune trace du monstre marin. Philéas et Passepartout essaient d'appâter le monstre depuis un canot, ils sont alors attaqués par un groupe de requins.

Ayant localisé le monstre, l'Abraham Lincoln se lance à sa poursuite. Philéas a de plus en plus de doute sur la nature du monstre ; il se déplace bizarrement et le harpon a rebondi contre sa peau. Finalement le monstre passe à l'offensive.

Philéas a découvert la véritable nature du monstre, c'est une machine, un sous-marin. Malheureusement, Philéas et ses amis sont capturés par son équipage. Ne trouvant pas de trace des disparus, le commandant de l'Abraham Lincoln décide de rentrer.

Bien que libres de circuler dans le Nautilus, Philéas et ses amis restent captifs du capitaine Nemo et de son sous-marin. L'un des membres de l'équipage, Pat', a une dent contre Philéas et cherche à tout prix à le faire passer pour un voleur.

Philéas a trouvé les lingots cachés dans sa valise et demande aussitôt à voir le capitaine Nemo. Une fois la situation éclaircie, ce dernier lui propose d'explorer les fonds marins avec ses amis lors d'une promenade en scaphandre. De nouveaux dangers font leur apparition dans les profondeurs.

Pat' a été enfermé mais cela ne dure pas. En effet, lorsque le Nautilus franchit un dangereux détroit, des turbulences lui permettent de s'échapper. Pat' prend Tico en otage et quitte le Nautilus avec des vivres et son prisonnier. Philéas doit trouver un moyen de secourir son ami.

Toujours captifs du Nautilus, Philéas et ses amis essaient de convaincre le capitaine Nemo de les relâcher mais ce dernier refuse car il souhaite préserver le secret du Nautilus. Le capitaine leur propose plutôt d'observer les pêcheurs de perles.

Ned cherche toujours un moyen de s'échapper. Malheureusement une tempête s'annonce et compromet son plan. Le Nautilus reste au fond de l'océan pendant que Philéas et le professeur Aronnax explorent la mythique cité engloutie Atlantis.

Le Nautilus a été aperçu par un navire, ce qui redonne un peu espoir aux amis de Philéas à Londres. Pendant ce temps, le Nautilus découvre d'étranges cavernes qui semblent cacher un mystère. Un terrible danger attend l'équipage du sous-marin.

Un navire de guerre a pour mission d'attaquer le Nautilus. À bord du sous-marin Ned met au point un nouveau plan pour s'échapper. Soudain l'Avenger, un navire de guerre, passe à l'attaque. La situation devient critique.