Thomas Shaw, un lanceur d'alerte, sévit dans le monde entier pour dénoncer les méthodes de la CIA. Il semble particulièrement actif à Berlin, où la CIA envoie Daniel Miller remonter la piste du dénonciateur. Sous couvert d'un simple agent de liaison, Daniel doit commencer son enquête au plus vite car Thomas Shaw sévit à nouveau et révèle que la CIA rémunère un employé des services secrets allemands.

Alors que le Berliner Zeitung vient de publier des documents transmis par le lanceur d’alertes Thomas Shaw, la prudence s’impose. Mais à l’encontre de l’avis de ses supérieurs très réticents, Valerie Edwards s’apprête à infiltrer le cercle rapproché d’un islamiste soi-disant repenti, un certain Aleksandre Iosava.

Alors que le terroriste Aleksandre Iosava organise à Berlin une levée de fonds pour une fondation d’aide aux réfugiés, Steven Frost et son adjoint Robert Kirsch s’inquiètent de voir étaler à la Une des journaux allemands leur gestion plus ou moins rigoureuse de certains de leurs contacts. Ils redoutent également les réactions du QG de la CIA, face à cette avalanche de révélations compromettantes. Pendant ce temps, Daniel Miller enquête sur un certain Julian DeVos.

Daniel s’embarque dans une opération périlleuse aidé par Hector ce qui ravive en lui des souvenirs douloureux liés à leur mission en Tchétchénie. Après l’éviction de la directrice adjointe de la CIA, Steven Frost se demande s’il n’y a pas là une occasion d’avoir une promotion. En suivant la piste d’Alexandre Iosava, Valerie Edwards découvre que sa femme Ruth est plus impliquée qu’elle ne le croyait.

Hector DeJean confie une nouvelle clé USB à Julian De Vos pour qu’il la donne au Berliner Zeitung : des informations concernant la présence en Allemagne de Lin, un transfuge chinois, protégé par les services secrets allemands et américains, qui a livré de considérables secrets nucléaires. Grâce aux écoutes, Miller intercepte l’information avant qu’elle ne sorte dans la presse et prend une longueur d’avance en renvoyant Lin en Chine afin de discréditer la fuite de Shaw.

Alors qu’Aleksandre et Ruth Iosava sont soupçonnés d’organiser les départs clandestins en Syrie de futures épouses pour les combattants de Daesh, l’Antenne de la CIA à Berlin tente d’obtenir le soutien de Krischan Ganz, le responsable des services secrets allemands, avant de se lancer dans une mission d’infiltration risquée. Leur idée : envoyer l’un de leur jeune officier traitant, Clare Itani, qui tiendra le rôle d’une future épouse destinée aux djihadistes du Califat. Un premier rendez-vous a lieu, dans un centre commercial.

L’Opération Iosava s’est soldée par un échec. Plusieurs clients d’un centre commercial sont morts et l’officier Clare Itani a été enlevée par l’épouse du terroriste. Hector DeJean, fou de douleur, s’en prend à la direction de l’Antenne de la CIA à Berlin qu’il juge incompétente et inefficace et avec l’aide de son ancien coéquipier Daniel Miller, il part régler la situation.

La CIA essaye de se couvrir après la mission de sauvetage désastreuse de Clare Itani. Hector est interrogé par un agent à la retraite qui travaille en sous-marin pour Frost et Miller afin de savoir s’il est Thomas Shaw. Soumis au détecteur de mensonge puis au sérum de vérité, il se remémore son affectation sur un site noir de la CIA où il avait pour mission de torturer des prisonniers.

Pendant son interrogatoire, DeJean revit des scènes de son passé au Maroc, quand il interrogeait Julian sous la torture. Incapable de le voir souffrir, il a arrangé son évasion et lui a conseillé d’aller en Espagne. Puis quand Robert et Valerie ont recruté DeJean, ce dernier a retrouvé Julian à Berlin sous les traits de Shirley Chair de Poule. Désireux de se venger de la CIA, DeJean a élaboré un plan pour devenir Thomas Shaw, le lanceur d’alerte, avec la complicité de Julian. Il a vite été contacté par Richter pour concentrer ses attaques contre l’antenne de Berlin.

Après le suicide de De Vos et les confessions d’Hector, alias Thomas Shaw, Daniel doit trouver un lieu sûr pour sa cousine, menacée par le BFV. Alors que Clay Williams lui assure qu’il va les exfiltrer, ils manquent de se faire tuer malgré les avertissements d’Esther, qui commence à douter du sens moral de Richter. En effet, Williams a passé un accord avec Richter pour éliminer Daniel et s’assurer que Steven Frost plonge pour l’enlèvement de Iosava.

Daniel Miller revient à Berlin pour s’infiltrer dans le milieu Néo Nazi alors que BB Yates prend les commandes de l’Antenne de Berlin. Katherina Gerahrdt à la tête du PFD, parti d’Extrême droite, commence à prendre la tête dans les sondages. Daniel se rapproche d’un ancien agent de la Stasi très puissant en se faisant passer pour un marchand d’armes.

Après les scandales à répétition dénoncés dans la presse allemande, plus de quatre mois se sont écoulés depuis le limogeage de Steven Frost, le directeur de l’Antenne de la CIA à Berlin. Alors qu’il a infiltré le milieu néo-nazi à la demande de la nouvelle directrice BB Yates, Daniel Miller, alias Trevor Price, présente Otto Ganz, un truand partisan des thèses d’extrême droite du PFD, à l’un de ses associés qui vit en Espagne, le soi-disant trafiquant d’armes, Andrew Chevalier.

Avec l’accord de BB, Valérie se rapproche de Josef qui semble vouloir obtenir l’aide de la CIA pour faire obstacle à la progression de Katerina Gerhardt à quelques jours des élections. Invitée à une réception au siège du PFD, Valérie parvient à pirater les comptes en banque du parti pour le prendre en flagrant délit lors du paiement des cent vingts kilos d’explosifs.

Daniel et Hector essayent de connaître la cible de l’attentat prévu par Otto Ganz. BB Yates essaye de mettre au point l’opération tout en évitant l’ambassadeur mais celui-ci lui soumet un ultimatum. Soit elle lui donne toutes les informations, soit elle est renvoyée aux Etats-Unis et rétrogradée. Valérie utilise Josef pour avoir accès à une carte située dans le sac à main de Gerhardt.

Alors que, comme prévu, cent-vingts kilos d’explosifs sont livrés à Otto Ganz, toute l’équipe de l’Antenne de Berlin est à la manœuvre, avec l’aide des Services de renseignements allemands, pour éviter un carnage qui, à la veille des élections, assurerait l’arrivée de nombreux députés du Parti néo-nazi de Katerina Gerhardt au Parlement allemand.

Steven et Robert partent en Norvège pour tenter de remonter à la source du financement illégal du PFD. Arrivés sur place, ils sont immédiatement accaparés par Nick Fischer, le chef de l’antenne d’Oslo, qui semble décidé à suivre les moindres faits et gestes de Robert. Steven, de son côté, découvre qu’un batelier norvégien injecte de très grosses sommes d’argent dans le PFD, par le biais d’un marché à poissons local. Les deux hommes décident d’aller interroger ce batelier, mais l’affaire va se corser quand ils découvrent qui est rééllement derrière tout ça.

Grâce à l’aide de Tim, April a mis Hector sur écoute permanente. Elle apprend qu’il est en train d’acheter une arme de précision pour abattre Katerina Gerhardt le soir de son élection au Bundestag. Partagée entre l’idée d’empêcher un meurtre et celle de supprimer une extrêmiste qu’elle considère être une future Hitler, April se demande si elle ne doit pas fermer les yeux et taire ce projet qu’elle est la seule à connaître au sein de la CIA. Daniel demande à Esther de laisser partir Lena mais les services secrets allemands veulent l’arrêter. Esther cherche à piéger la jeune fille lors d’un rendez-vous fixé à Hector à la gare centrale de Berlin.

Alors qu’un tireur isolé a tiré à plusieurs reprises sur Katerina Gerhardt, au moment où elle remerciait ses nombreux partisans et militants de la victoire emportée par le PFD aux récentes élections, Valerie apprend que BB Yates n’est pas encore rentrée à Langley et qu’elle a obtenu des informations qui pourraient faire avancer leur enquête sur les néo-nazis.

Tandis qu’Hector se cache dans l’Ambassade américaine et que la grogne monte dans les rues de Berlin, le BFV décide de couper tout contact avec la CIA et leur ordonne de livrer Hector aux autorités allemandes avant la fin de la journée. Daniel et April tentent de remonter la piste menant au contact de Fischer. De son côté, Robert avoue à son fils sont vrai travail, et trouve enfin un compromis avec Hanes. Puis, il tombe nez à nez sur BB, qui lui révèle le coup qu’elle a monté avec Valérie pour démasquer Josef. Mais celui-ci finit par comprendre que Valérie a joué un double-jeu.

Quatre ans se sont passés depuis les derniers événements à Berlin. Valérie est devenue la chef de l'antenne berlinoise de la CIA, et Daniel, Robert et April travaillent sous ses ordres. Daniel enquête sur un ancien agent de la CIA qu'il suspecte d'avoir assassiné sa mère.De son côté, Valérie est informée que Rafael Torres, l'agent de la CIA basé en Estonie, a repéré des membres des forces spéciales russes sur le sol estonien. Torres pense que la Russie veut mettre le feu aux poudres en se servant des ressortissants russes mal intégrés en Estonie afin de semer le trouble et, à terme, annexer l'Estonie à la Russie.

Alors qu’à Tallinn, on fête le centenaire de l’indépendance de la république d’Estonie, Sofia Vesik s’apprête à lancer sa nouvelle application, celle qui permettra à tous les résidents du pays d’avoir les mêmes droits et le même passeport. Y compris pour la minorité russophone, mal intégrée. De son côté, Daniel Miller part vérifier l’existence d’une voie ferrée soi-disant désaffectée qui pourrait avoir servi récemment à transporter des militaires russes. Mais rien ne se passe comme prévu…

La station de Berlin enrôle Rafael Torrest pour retrouver Daniel Miller qui n’a pas donné signe de vie depuis son dernier rapport alors qu’il suivait une piste au milieu d’un territoire hostile. Robert Kirsh est mandaté pour retrouver un vieil ami de la CIA qui s’est mis en tête de livrer ses secrets d’espion à un animateur de podcast.

Alors que Rafael Torres fait appel à un ami, un militaire anglais en poste à la Base militaire de l’Otan, afin de pouvoir rapatrier en Allemagne ce corps calciné retrouvé à Turba, l’équipe se démène pour obtenir des preuves de l’ingérence russe sur le sol estonien. De son côté, Esther Krug continue son enquête sur un mystérieux intervenant, un certain Diver, qui avait fait libérer Henrik Viiding des geôles de la Stasi, durant la chute du mur de Berlin. Pendant ce temps, un chalutier de pêche est victime d’un grave incident, dans le Golfe de Finlande…

Alors que Robert Kirsh et Rafael Torres sont envoyés à Vienne pour rencontrer le seul trafiquant d’armes capable de leur indiquer le nom de l’acheteur du stock d’armes retrouvé à Turba, Valerie tente désespérément de convaincre son supérieur à Langley des risques d’une future invasion de l’Estonie par les Russes…

Valérie et Robert annoncent à B.B qu'ils veulent convaincre l'OTAN de faire voter l'Article Cinq pour venir en aide à l'Estonie et engager une offensive contre la Russie. Mais pour ce faire, ils vont avoir besoin de l'appui des Quatorze membres les plus influents de l'OTAN.De leur côté, Steven Frost et Rafael Torres se rendent à Saint-Pétersbourg pour tenter d'approcher Vassily Krik grâce à l'aide du contact de Frost sur place, qui n'est autre qu'Hector DeJean. Ce dernier a réussi à infiltrer le cercle fermé des gros poissons russes, en devenant un passeur de marchandises de luxe.

A quelques jours de la session de l'OTAN qui doit statuer sur l'invasion de forces russes en Estonie, Kolya propose à Robert Kirch d'échanger Daniel Miller contre Basarov le plus tôt possible. Le Groupe des quatorze, à savoir les services de renseignement de quatorze pays, doit se réunir pour savoir si l'invasion qui se prépare en Estonie relève de l'article cinq du traité de l'Atlantique-Nord et peut être considéré comme une attaque faite à l'OTAN. Valerie et April cherchent des preuves pour tenter de convaincre ces pays.

Tandis que Daniel et Hector tentent d'échapper aux hommes de Krik, Steven met enfin la main sur une vidéo compromettante sur Krik grâce à l'aide de son contact en Afghanistan. De son côté, Torres parvient à retrouver Daniel et à lui fournir un portable afin qu'il contacte l'antenne berlinoise. Dès que Valérie et Robert apprennent qu'il est encore en vie, ils demandent à l'état-major de l'évacuer. Mais Steven insiste mystérieusement pour aller le chercher lui-même, prétextant que les Seals n'arriveront jamais à temps. April essaie de découvrir qui a pu piéger les Adeyemi pour s'emparer de leur invention.

La police de Berlin retrouve un cadavre qu'Esther Krug identifie comme étant celui de Daniel Miller. Toute l'antenne de Berlin et Esther Krug sont sous le choc. Les circonstances de sa mort ne sont pas connues et le clan russe est soupçonné, d'autant qu'on n'a aucune nouvelle de Frost. Hector et Torres sont eux aussi portés disparus. Mais Torres est en train de convaincre Platov, qui a repris la tête du complot, de vendre la collection d'art de Krik afin de financer l'invasion de l'Estonie.

Alors que Tallinn est plongé dans l’obscurité à la suite d’une panne de courant, Valérie Edwards et son équipe se démènent pour éviter un probable coup d’état en Estonie, fomenté par un groupe d’intervention à la solde de l’Armée Russe… Pendant ce temps, Robert Kirsh se méfie de plus en plus de Nina Bartek, tandis que Steven Frost, de retour à Berlin après avoir échoué à exfiltrer son ami Daniel Miller, doit s’entretenir au plus vite avec Gilbert Dorn …