Il y a cinq ans, Lux, le fils de l'ancien empire arcadien, renversé par un coup d'État, est devenu le pécheur du nouveau royaume d'Artismart, et a signé un contrat pour accepter toutes sortes de petits boulots de la part des citoyens, et a travaillé dur chaque jour pour faire toutes sortes de travaux. Un jour, lors d'une panne de toit, Lux tombe dans les bains de l'école où étudient les filles et voit le corps nu de la princesse du nouveau royaume, Liz Charlotte.

Lux, qui fréquente l'école créée pour former des jeunes filles aux valeurs d'adaptation élevées pour les kiryu blindés, se voit confier diverses tâches tout en étant observé avec curiosité par les jeunes filles. Cependant, Kururusifa, l'une des filles les plus talentueuses de l'école, cherche à savoir si Lux est le « Héros Noir » qui aurait détruit l'ancien empire.

Les élèves organisent une fête pour célébrer l'entrée de Lux dans l'école, mais le directeur de l'école de Riley sort un tas de lettres de procuration des étudiantes à Lux, et propose en guise d'after un « Lux Scramble » : pour éliminer le mécontentement des élèves qui n'ont pas confié de travail à Lux, tant que vous pouvez prendre la lettre de procuration spéciale de Lux, vous pourrez lui confier une semaine de corvées pendant une semaine. Pour éliminer le mécontentement des étudiants qui n'ont pas mandaté Lux, s'ils peuvent prendre la commission spéciale de Lux, ils pourront le mandater comme homme à tout faire pendant une semaine.

Les Tours vont enquêter sur une mystérieuse relique, et bien que Kururushifa soit une étudiante étrangère venant d'un autre pays, elle insiste pour participer à cette dangereuse enquête sur la relique. Le jour de leur départ, Barzelito apparaît devant eux, affirmant qu'il va les aider pour le bien de sa fiancée.

Tout cela n'était qu'un complot de Barzelito : après avoir appris le secret de la naissance de Kururusifa, il s'est approché de cette dernière afin d'obtenir son pouvoir. Balzelidor vainc Kururusifa avec une puissance incroyable, et alors qu'elle est au bout du rouleau, un Kiryu noir apparaît dans le ciel éclairé par la lune.

Avec l'apparition d'une personne inconnue suspecte dans l'école, les Cherries demandent à Lux de mettre un costume de femme et de partir en patrouille. Lorsque Lux accepte de le faire, il est menacé avec un couteau par une personne suspecte qui apparaît soudainement alors qu'il patrouille dans l'enceinte de l'école. À ce moment-là, la personne qui est apparue pour l'aider est Celestia Langrisse, la fille aînée des quatre grands nobles et la chef des Chevaliers, qui est connue comme étant « la plus forte de l'académie ».

Les Luxes viennent sur l'île pour renforcer l'hébergement commun, mais les filles se mettent en maillot de bain et s'amusent sur la plage. Cependant, le directeur de l'école, Riley, arrive également et demande à Lux et Cerise de se battre. Alors qu'elles se battent, la Bête Fantôme entre soudainement dans la salle d'entraînement, et une personne suspecte se trouve derrière elle.

Une énorme relique en forme de navire apparaît soudain, et le véritable objectif du Hopper est d'enquêter sur cette relique - l'Arche. Divisé en quatre groupes, Lux entre dans les ruines pour enquêter et trouve une jeune fille allongée sur le sol sous les décombres. La jeune fille prétend être l'administratrice de l'arche, et que l'arche a besoin d'être réparée car la plupart de ses fonctions se sont arrêtées.

Grâce à Haze, Lux apprend la vérité sur la dissimulation de Philphe et obtient la confirmation des souvenirs qui lui restent. Lux se souvient que lorsqu'il était jeune, c'est Philphe qui l'a sauvé du désespoir. Depuis, Lux s'est engagé à se battre pour Philphée. Lux est déterminé à sauver Philphée cette fois-ci et avance vers les ruines.

Le festival national du nouveau royaume de Yatismart approche. Afin de passer du temps avec Lux pendant les festivités qui durent plusieurs jours, les jeunes filles espèrent avoir un rendez-vous avec lui. Mais Lux n'a pas beaucoup de temps libre, car il y a encore des commandes en attente. C'est pourquoi Riley suggère à Lux de choisir trois personnes dans la foule pour sortir avec lui.

Lux a entendu parler du « Plan de reconquête de la capitale impériale » par le chancelier. Il est dit que ce plan sera mis en œuvre à la fin de la Bataille des dragons, lors de la cérémonie de fondation. Afin d'arrêter le complot, Lux est invité à coopérer et à servir de leurre pour attirer les 100 Phantom God Beasts qui se cachent dans l'ombre. Il lui est également demandé de remporter la victoire lors de l'All-Dragon Battle.

Tout n'était qu'un piège bien préparé, et Lixia a été capturée par l'ennemi. Lagrito a mené l'armée rebelle à tuer, tandis que l'armée du Nouveau Royaume se défendait, une ombre immense est apparue. La bataille décisive pour la protection du nouveau royaume d'Atismart commence dans un contexte de crise entre la vie et la mort.