Une terrible attaque détruit la ville d’Odessa, le rêve de paix entre les Humains et les «évolués» est rompu... Ils sont alors traqués par Joanne et Luke qui les recherchent sans relâche pour venger leur fils tué lors de l'assaut.

Noah Bennet et Quentin Frady tentent de déceler la vérité derrière le drame d’Odessa. Pendant ce temps, à Tokyo, Miko recherche son père.

Tandis que la puissante organisation Renautas révèle jusqu’où on peut aller pour protéger le monde des «évolués», Noah Bennet et Quentin continuent leurs recherches visant à déjouer le complot.

Miko poursuit son voyage, à la recherche de son père et de son épée. De son côté, Tommy doit utiliser son don pour sauver la vie d'un proche et Luke fait face à des obstacles inattendus.

Le plan échafaudé par Miko pour retrouver son épée pourrait lui attirer des ennuis. Pendant ce temps, Luke se confronte à son passé et Malina fait un voyage très révélateur.

Miko parvient à libérer Hiro Nakamura. Tommy et Emily font une escapade à Paris. Carlos emmène Dearing jusqu'au Manoir Sunstone, mais celui-ci trouve le moyen de le piéger. Malina sauve la vie de Luke, qui décide de l'aider à retrouver Tommy.

Hiro et Noah arrivent au sommet de l'Unité, le 13 juin, dans l'espoir d'empêcher l'attentat et de sauver Claire. On découvre qu'Angela a essayé de dissuader Mohinder de parler au sommet, après avoir eu une vision.

Hiro et Angela sont coincés en 1999, car les bébés de Claire privent le téléporteur de ses pouvoirs. Ainsi le 13 juin, Noah va à la rencontre de Hiro, c'est une version âgée de 16 ans de plus qui l'attend.

Dearing et Carlos arrivent au manoir, et chacun de leur côté rencontrent le directeur, qui a le pouvoir de lire dans les pensées. Une fusillade a lieu Chez Moe, entre Joanne, Luke, Caspar, Emily et Tommy, mais ce dernier arrête le temps.

Noah emmène Malina à Odessa, pour qu'elle y retrouve son frère. Sur le trajet, ils croisent Luke, qui souhaite les accompagner. Noah, très méfiant, décline la proposition mais Luke ne se laisse pas abattre et les suit en voiture.

Luc et Malina se réunissent pour sauver Tommy et l’humanité à la suite de la disparition de Noah. Pendant ce temps, au manoir Sunstone, une bataille menée par Matt Parkman fait rage pour libérer des prisonniers.

Selon l’avis de hauts responsables scientifiques, la première des deux énormes éruptions solaires frapperait l’Amérique du Nord au moment même où la force magnétique des pôles s’inverserait. Toute l’humanité serait alors menacée...

Tommy fait face à un immense challenge. Erica n'a plus aucune limite pour arriver à ses fins. Luke et Quentin viennent en aide à Malina pour réaliser la prophétie de son grand-père. Emily et Ren cherchent Miko, alors que Carlos saisit sa chance...