Une invasion extraterrestre, inattendue et destructrice, a décimé la population terrestre. La planète est en lambeaux, toutes les infrastructures ont été détruites et seuls quelques rares humains ont survécu au cataclysme alien. Tom Mason, un professeur d'histoire dont la femme est morte pendant l'attaque extraterrestre, prend les commandes d'un groupe de résistants, le 2e régiment du Massachusetts. Parallèlement à ses activités de combattants, il doit s'occuper de ses fils. L'un d'entre eux est captif des aliens : Tom se fait fort de le retrouver et de le délivrer...

Tom et Hal, partis en mission de ravitaillement, tombent dans une embuscade tendue par un gang de maraudeurs dirigés par un certain John Pope, un mercenaire sans foi ni loi. Pope compte utiliser ses deux prisonniers pour faire main basse sur un stock d'armes, caché depuis le début de l'invasion alien...

Le docteur Michael Harris rejoint le groupe de résistance du 2e régiment du Massachusetts. Il devient un allié précieux du groupe en proposant un plan pour délivrer les adolescents prisonniers des extraterrestres. Mais Tom, qui se pose moult questions depuis l'invasion alien, n'adhère pas pleinement à la proposition de Harris. Parallèlement, les hommes du 2e régiment, en route pour sauver Ben Mason, se heurtent à des ennemis et des robots surarmés...

Tom et son équipe se préparent à partir en mission pour tenter de récupérer des motos. Par précaution, ils demandent à John Pope de se joindre à eux. Mais en cours de route, ils sont attaqués par une entité inconnue. Leur agresseur semble bien plus redoutable que les Aliens, ce qui ne manque pas de les inquiéter...

Toujours plus déterminé, Hal Mason met en place un nouveau plan, aussi risqué qu'audacieux, afin d'infiltrer un repaire de skitters. Il compte ainsi délivrer son frère Ben et de nombreux autres adolescents, kidnappés par les extraterrestres. Mais il sait qu'il s'expose et met sa vie en danger...

Terry Clayton, le chef d'un groupe de résistants, se présente au camp. Il vient avertir d'une attaque imminente des extraterrestres. Il propose de prendre soin des enfants et de les mener en lieu sûr. Tom et les autres hésitent à lui faire confiance et à accepter son aide. Mais le temps presse : une décision doit être prise avant que l'assaut alien et les combats ne débutent d'autant que la sécurité des enfants est la priorité de Tom...

Hal commence à se demander si la ferme est véritablement le havre de paix idyllique décrit par Clayton. Les enfants seraient-ils en danger ? Lorsque Mike découvre par hasard l'horrible réalité, ils se retrouvent tous deux contraints d'affronter un ennemi imprévu...

Le comportement de Weaver devient de plus en plus étrange et incontrôlable. Tom et Hal le constatent au cours d'une mission de reconnaissance qu'ils effectuent en sa compagnie. De son côté, Pope s'active à construire une nouvelle arme capable de modifier le cours des combats. Pendant ce temps, Anna autopsie le cadavre d'un Skitter : elle fait ainsi une découverte qui la laisse pantoise...

Les tensions entre Tom et Weaver menacent la cohésion du groupe. En effet, le capitaine veut absolument organiser une attaque de grande ampleur sur la structure alien qui est basée à Boston. Mais les risques sont grands et Tom cherche aussi à protéger les civils. De plus, grâce aux découvertes de Anne sur les Skitters, Tom comprend que les envahisseurs sont plus complexes qu'il n'y paraît...

Les combattants de la résistance lancent une attaque contre les aliens. Tom, lui, reste au camp, afin de protéger les civils. De leur côté, Hal, le capitaine Weaver et Scott échafaudent une initiative des plus risquées. Les motivations des aliens trouveront-elles enfin un début d'explication ?...

Tom est parti depuis trois mois à bord du vaisseau extraterrestre. Hal et Ben, devenus des combattants aguerris, continuent de venir en aide à ceux qui ont souffert des combats. Mais ils ne pensent en réalité qu'à une chose : retrouver leur père. Le capitaine Weaver essaie tant bien que mal de coordonner les opérations de la résistance. Pendant ce temps, Matt tente de trouver sa place dans ce monde bouleversé. De son côté, Anne se montre progressivement plus maternelle avec les fils Mason...

La résistance manque de tout et le combat est inégal, d'autant que les extraterrestre ont mis en oeuvre des moyens colossaux. L'invasion est-elle irréversible ? Faudra-t-il composer définitivement avec ces créatures si radicalement différentes ? Tandis que les actions d'éclat des résistants se succèdent, certains humains veulent encore croire à la possibilité d'une cohabitation en bonne intelligence. Pendant ce temps, l'état de santé de Tom inquiète ses fils et Weaver...

Le capitaine Weaver tente d'adapter sa stratégie en permanence. Peu à peu, les informations dont dispose la résistance permettent aux combattants de cibler des objectifs plus pertinents. De leur côté, les extraterrestres continuent de traquer les êtres humains. Leur avance technologique suffira-t-elle à maintenir leur suprématie ? Alors qu'ils patrouillent, Ben et Jimmy sont surpris par des extraterrestres : les choses tournent mal. Enfin, les relations entre Tom et John Pope se tendent de plus en plus et deviennent violentes...

Voulant prouver son courage, Matt, le plus jeune fils de Tom, sert d'appât pour piéger deux Skitters. En apprenant cette nouvelle, Tom lui fait la leçon. En patrouillant, Hal et Ben se font voler leurs motos. Ils découvrent une bande d'adolescents, avec parmi eux Jeanne, la fille de Weaver et son petit ami Diego...

La présences d'espèces extraterrestres différentes au sein des humains complique considérablement la situation, pourtant déjà peu simple. Vraisemblablement, les enfants asservis ne pourront jamais retrouver une vie normale. Sur le terrain, malgré tout, Tom tente de ne pas perdre courage, et de ne pas laisser l'initiative aux aliens...

Weaver s'évanouit. Il est victime d'une toxine inconnue, entrée dans son corps à la faveur de sa blessure à la jambe. Bientôt, il se retrouve en danger de mort. Tom se retrouve par conséquent propulsé à la tête du 2e Régiment. C'est alors que Hal et Maggie découvrent Karen inconsciente. Elle gît au milieu d'autres jeunes gens faits prisonniers par les Skitters. Tous sont morts, sauf elle. Ben pense qu'elle est toujours liée aux ennemis. Enfin, la relation entre Anne et Tom est mise à l'épreuve par la maladie de Weaver et l'ambiance générale : des conflits émergent...

Les forces d'occupation extraterrestres pourchassent les humains avec de plus en plus de hargne et de violence, les traquant sans répit et sans pitié. Pour réduire à néant toute possibilité de résistance, des opérations de destruction massives sont même enclenchées. Pendant ce temps, le capitaine Weaver tente de faire front, soutenu tant bien que mal par ses maigres troupes. Ben, de son côté, est trahi par quelqu'un en qui il pensait pouvoir mettre sa confiance tandis que Tom capture un autre otage...

Les rescapés du 2e régiment du Massachusetts poursuivent leur route vers Charleston. Cependant, le moral des troupes est atteint : les pertes humaines des derniers affrontements sont encore fraîches dans les coeurs. En chemin, la troupe recueille une jeune fille qui a un harnais alien. Matt se charge de la soigner et finit par s'attacher à elle. Pendant ce temps, Weaver parvient à en apprendre un peu plus sur le passé de Tector et la vie qu'il menait avant l'invasion extraterrestre...

Des volontaires se présentent pour rejoindre le 2e Régiment du Massachusetts. Ces nouvelles recrues sont accueillies avec plaisir par les vétérans. En effet, leurs rangs ont été décimés, et ils sont soulagés de voir arriver ces gens dynamiques et motivés. Tom retrouve à cette occasion un de ses anciens professeurs, le docteur Arthur Manchester. Mais bien vite, l'enthousiasme du début cède la place à la suspicion. Pendant ce temps, Tector admet son passé et Maggie comprend que Pope désire quitter le groupe...

Grâce aux récentes recrues venues renforcer ses effectifs, le 2e régiment du Massachusetts peut à nouveau mener des actions contre les envahisseurs. Mais les extraterrestres ont, eux aussi, modifié leurs tactiques et déploient de nouvelles armes sur le champ de bataille. Les humains se retrouvent confrontés à des menaces inédites. Dans ce chaos, Tom apprend quelque chose qui le bouleverse...

La résistance est maintenant épaulée par un nouvel allié dans sa guerre contre les envahisseurs, le peuple des Volms. Tandis que Tom prend la direction du pays, Hal, de son côté, est en proie à des cauchemars particulièrement angoissants, qui le laissent épuisé au réveil...

Pour mener à bien son combat, Tom sollicite l'avis et l'aide d'un expert en physique nucléaire. Hal fait des cauchemars à cause de sa relation avec Karen. Enfin, l'équipe découvre qu'il a une taupe en son sein...

Les résistants rassemblés à Charleston se préparent pour une offensive attendue des Esphenis. A l'arrière de la base, pendant ce temps, Hal poursuit sa rééducation sous le regard de Tom : il apprend à remarcher à l'aide de béquilles. Tom, lui, surveille de près les efforts déployés par Jeanne pour ériger un arbre de la Liberté, hautement symbolique, dans le parc de la petite ville...

Des Mega-Mechs mettent le feu aux remparts extérieurs de Charleston. Hal et les autres parviennent à les tenir à distance, mais au prix d'une lourde lutte. Pendant ce temps, au QG, Katherine demande à pouvoir rejoindre la bataille...

L'avion de Tom et Pope s'est écrasé. Tom reprend ses esprits, miraculeusement indemne. Après avoir constaté que le pilote est mort durant le crash, il réussit à sortir Pope vivant des débris de l'appareil, et ce malgré les flammes qui font rage. Tous les deux vont devoir regagner Charleston par leurs propres moyens. Pendant ce temps, en ville, Hal est réveillé par Ben, qui lui apprend qu'Anne et sa fille Alexis sont portées disparues. Le colonel Weaver part sans plus attendre à leur recherche...

Tom apprend que Karen retient Anne et Alexis prisonnières. Tom aimerait les chercher le plus rapidement possible, mais il se rend finalement à la raison : il vaut mieux attendre des nouvelles de Karen avant d'agir...

Les hommes de Mason continuent à chercher Anne et Lexi. Ben demande à son papa s'ils retourneront à Charleston une fois qu'ils les auront retrouvées. Soudain, dans l'obscurité, ils entendent bouger sur la falaise : ils découvrent un rebelle blessé qui leur conseille de partir au plus vite. Tom et Ben retournent au camp et avertissent Hal et Matt qu'il leur faut se mettre en route....

Weaver recherche qui est la taupe à Charleston, alors que Maggie attend le retour d’Hal et de sa famille. Tom se réveille auprès de sa femme, à la période de Noël, mais il devient vite suspicieux.

Tom retourne à Charleston. Tout le monde est heureux de le voir. Il se rend chez Weaver et Porter pour leur dire qu'ils devraient attaquer la tour de Boston. En réalité, tout ce que cherche Tom, c'est la mort de Karen. Porter pense lui aussi que le meurtre de Karen pourrait leur donner l'avantage dans cette guerre. C'est alors qu'une explosion compromet les projets de contre-offensive du gouvernement de Charleston. Et le traître qui sévit perd son anonymat au cours de cet événement...

Weaver, Pope et quelques autres sont dans un train à destination de Chicago. Ils s'inquiètent au sujet de l'arme des Volm : fonctionnera-t-elle ? Lourdes, embarquée, est censée servir d'appât pour les aliens. Pendant ce temps, Hal et Maggie discutent de ce qu'ils feront quand la guerre sera enfin terminée, ce qui ne saurait tarder. La victoire finale approche à grands pas...

Une nouvelle machine de guerre Espheni, bien plus meurtrière que toutes les précédentes, menace la résistance.

Les Espheni révèlent leur plan à Tom. Celui-ci se retrouve dans une situation délicate, confronté à un choix cornélien. Pendant ce temps, Weaver et Pope tentent de trouver une solution pour quitter la prison Espheni, tandis que Matt, toujours au camp de jeunes Espheni, se bat pour cacher sa véritable appartenance. Enfin, Anne mène une épuisante quête pour retrouver sa fille...

Tom et le 2nd Mass créent un plan pour s’évader du ghetto Espheni où ils sont prisonniers. Ben révèle à Maggie ce qu’il a découvert sur Lexi et ensemble, ils la confrontent publiquement. Au camp pour jeunes, Matt tente de raisonner Mira pour éviter qu’elle se mette en danger. Le groupe d’Anne continue sa route jusqu'au moment où elle perd connaissance.

Après s’être échappés du ghetto Espheni, Tom et le 2nd Mass trouve refuge dans une cachette des Volm. Rapidement, Tom part à la recherche de Matt, laissant Hal à la tête du groupe. Anne est réunie avec Lexi, mais rencontre des difficultés à communiquer avec sa fille.

Après avoir délivré Matt du camp de jeunes Espheni où il était détenu, Tom croise la route de deux étrangers, dans les bois. Ceux-ci attaquent sa famille et l'entraînent dans un périple violent. Hal affronte bien des dangers pour mener la 2e Division en sécurité. Lexi et Anne ne sont pas d'accord, et leurs divergences d'opinion pourraient avoir des conséquences très funestes...

Après des mois sans se voir, Tom retrouve enfin sa famille. Mais la joie est de courte durée, car Lexi est victime d'un problème de santé lié à son ADN hybride. De son côté, Anne est prête à tout pour sauver sa fille...

Lexi est plus puissante et impitoyable que jamais. Tom et la 2e Division doivent travailler avec les Volms pour contrer l'invasion des Esphenis. La bataille risque d'être dure et particulièrement sanglante...

La 2e Division se remet de la violente attaque alien, qui a tout dévasté. Maggie se bat contre la mort. Hal est à ses côtés, luttant avec elle. Pendant ce temps, Tom et Dingaan sont coupés du reste du groupe, enterrés sous les tonnes de décombres. Ils ne peuvent compter que sur l'ennemi pour les sauver...

Tom et une petite équipe se rendent à une cachette volm, espérant trouver du matériel et des équipements. En chemin, ils rencontrent une connaissance, et doivent rapidement décider s'ils peuvent lui faire confiance, ou pas. Au camp, Maggie et Ben sont de plus en plus proches, à mesure que Ben apprend à Maggie à utiliser et augmenter ses nouvelles performances. Pope et Sara, eux, continuent de se heurter. Ils finissent par entrer dans un conflit dont ils n'imaginent pas l'issue...

Tom et les rescapés de la deuxième Division, toujours déterminés à anéantir les forces esphénis, tirent à la courte paille pour désigner celui qui s'engagera dans la prochaine mission, particulièrement périlleuse. La menace de mort qui pèse sur les têtes libère la parole, longtemps contenue : de violentes confrontations ont lieu qui, contre toute attente, renforcent un peu plus les rangs de la Division...

Tom a pour mission de détruire le centre de pouvoir esphéni. Mais son projet est contrarié par le retour de Lexi, forcée de prendre des mesures extrêmes pour sauver la vie de son père, et la sienne aussi par la même occasion. Pendant ce temps, la 2e Division craint une attaque esphéni...

Le sort de l'humanité repose désormais sur les épaules de Tom et de Lexi, qui doivent trouver un moyen de battre le pouvoir esphéni. Pendant ce temps, une terrifiante bombe esphéni menace la 2ème Division...

Un ultime combat contre les envahisseurs se prépare. Tom, la Division, ses amis et sa famille se préparent, car de l'issue de la bataille dépendra la destinée de la race humaine sur Terre...

Les skitters ont mené une attaque surprise contre la 2e Division. Les réserves de nourriture ont été détruites au cours de l'opération. Tom et Anne font une surprenante découverte...

L'équipe trouve la source des forces a priori inépuisables de ses ennemis : une découverte capitale qui permet de planifier une contre-attaque efficace. Parallèlement, Ll leadership de Tom commence à s'étendre à toutes les milices humaines dispersées dans le monde. Hal désobéit à son père afin d'aider Maggie, et Tom doit faire un choix décisif, qui aura d'importantes répercussions...

Une mission destinée à trouver des véhicules et du carburant tourne mal. Pope, désemparé, décide de prendre les choses en main. Cochise échange des nouvelles troublantes avec Anne. Et l'quilibre mental et la loyauté d'Anthony sont mises à l'épreuve...

Les membres de la 2e Division quittent le quartier de Chinatown, se dirigeant vers ce qu'ils espèrent être la toute dernière bataille contre les Esphenis. En route, ils dérangent un forcené, qui prend Weaver en otage. Pendant ce temps, Tom tente de se porter au secours de Hal, prisonnier de Pope et de son groupe de dangereux survivants...

Tom trouve refuge auprès d'une famille qui a pris ses distances avec les combats. Il découvre ainsi ce qu'est la vie loin du front et de la guerre...

La Seconde Division arrive enfin dans une zone de sécurité, une base militaire toujours en fonction, dirigée par une ancienne conquête de Weaver. Les deux groupes se mettent à échafauder des plans pour l'assaut final contre les Espheni. C'est alors que les membres de la Division réalisent que les choses ne sont pas exactement ce qu'elles paraissent être...

Weaver fait une découverte surprenante au sujet d'une vieille connaissance. Choqué par le secret ainsi mis au jour, il entreprend de protéger les membres de la 2e Division. Maggie et Isabella, de leur côté, travaillent ensemble...

Tandis que Tom trouve une nouvelle arme contre les ennemis, Ben tente de découvrir le plan des aliens. Le temps presse, la confrontation finale approche à grands pas, et Tom et les autres savent qu'ils n'ont pas droit à l'erreur s'ils veulent sauver la race humaine et la Terre...

Les Mason, le 2e Régiment et leurs nouveaux alliés sont dans une impasse. Bientôt, tous se retrouvent dans un endroit emblématique. Ils s'engagent dans l'ultime combat contre les aliens. Le sort de l'humanité est en jeu...