Au XXe siècle, les Terriens achèvent leur premier vaisseau intergalactique, l'Enterprise, doté d'un moteur révolutionnaire. Le capitaine Archer s'apprête à embarquer à son bord avec son équipage lorsqu'un Klingon blessé est capturé en Oklahoma. Les Vulcains, qui sont chargés de l'enquête, demandent sa mise à mort pour des raisons de fierté et d'honneur. Mais cette requête est refusée par les Terriens. Archer intervient et propose de ramener le blessé chez lui avec son vaisseau, en signe de paix. C'est ainsi que débute le premier voyage de l'Enterprise, qui emporte les pionniers du voyage spatial... L'équipe de l'Enterprise est à la recherche de son prisonnier Klingon qui vient d'être enlevé. Mais Jonathan Archer et son équipage tombent dans un guet-apens, tendu par des Sulibanes. Pris à part, Archer apprend d'un renégat que certains Sulibanes cherchent à provoquer une guerre entre les Klingons. En voulant rejoindre son vaisseau, Archer est blessé par un tir...

Continuant à explorer les galaxies, l'équipage de l'Enterprise espère bientôt rencontrer une planète habitée. Il tombe soudain nez à nez avec un vaisseau alien. Ce dernier contient une quinzaine de corps d'humanoïdes suspendus au plafond, qui semblent avoir été utilisés pour des expériences scientifiques plutôt étranges.

L'Enterprise rencontre enfin une planète. Celle-ci est bleue et la présence d'oxygène permet aux membres de l'équipage de l'explorer sans équipement spécial. T'Pol s'oppose à cette mission mais le capitaine Archer reste sur ses positions. Une équipe est envoyée sur place. Cette planète qui ressemble beaucoup à la Terre est un enchantement. Mais très vite, des membres du groupe sont menacés par un vent violent. Tucker décide d'aller se réfugier dans une grotte. Peu de temps après, Ethan commence à présenter d'inquiétants troubles du comportement...

Trip est chargé de réparer un vaisseau alien qui connaît des problèmes de puissance et recharge ses batteries à partir du plasma de l'Enterprise. Si, au début, il ne semble que peu ravi par ce travail, il change rapidement d'avis lorsqu'il rencontre une belle technicienne travaillant sur le vaisseau en question...

Il y a 75 ans, un vaisseau quittait la Terre pour se rendre sur la planète Terra Nova, afin d'y établir la première colonie humaine hors du système solaire. L'opération fut un succès, jusqu'au jour où la Terre perdit mystérieusement tout contact avec les exilés. L'équipage de l'Enterprise, qui approche de Terra Nova, est chargé de découvrir ce qui s'est passé...

Le capitaine Archer décide de visiter, avec l'équipage de l'Enterprise, le P'Jem, un sanctuaire Vulcain réservé à la méditation et à la recherche de la sérénité absolue. T'Pol désapprouve cette visite et redoute qu'elle ne soit mal interprétée par les fidèles du temple. Arrivés sur les lieux, Tucker, Archer et T'Pol découvrent que d'étranges extraterrestres ont pris le contrôle du sanctuaire...

L'équipage de l'Enterprise découvre la plus grosse comète jamais observée par des humains. T'Pol détecte à sa surface la présence d'une grande quantité de psyllium, un minerai très rare. Le capitaine Archer envoie Reed et Mayweather en mission d'exploration. Il ignore qu'un vaisseau Vulcain les observe avec attention...

Le capitaine Archer et son équipage découvrent une planète très peuplée qui ressemble étrangement à la Terre telle qu'elle était au XIXe siècle. Ils décident de se faire passer pour des habitants de cette mystérieuse planète afin d'enquêter sur ce nouveau territoire, qui leur est terriblement familier. Au cours d'une analyse de routine, T'Pol détecte la présence d'un réacteur matière-antimatière dans les sous-sols d'une des villes. La présence d'un tel dispositif amène l'équipage à se méfier un peu plus de cette planète. Le capitaine Archer tente de comprendre ce qui se passe en ces lieux...

Le capitaine Archer est contacté par l'amiral Forrest. L'Enterprise doit aller porter secours à un vaisseau cargo, le «Fortunate», qui ne répond plus aux appels. L'équipage de l'Enterprise retrouve bientôt le bâtiment, sérieusement endommagé par une attaque perpétrée par un groupe de dangereux pirates nausicaans. Mais son capitaine tient absolument à se venger et refuse l'aide du capitaine Archer...

Quelque part dans le quartier général du Cabal, Silik subit de nouvelles modifications génétiques, tout en essuyant les réprimandes de l'«Inconnu du futur» à cause de l'échec de sa mission précédente. En effet, l'Empire Klingon n'est pas entré en guerre civile comme prévu. Mais Silik se voit confier une nouvelle mission...

L'équipage de l'Enterprise vient d'installer le premier relais de communication ainsi qu'un second relais «subspatial», qui va permettre à Archer et aux premiers pionniers de communiquer directement avec la Terre...

Depuis l'installation du relais «subspatial» qui permet enfin à tout l'équipage de communiquer avec la Terre, les messages sont de plus en plus nombreux. La linguiste Sato remarque, avec étonnement, que la plupart de ces communications concernent le docteur Phlox. Il ne sait trop comment réagir...

L'Enterprise rencontre une géante gazeuse de type 9 et décide d'envoyer une sonde afin de l'étudier de plus près. La sonde révèle la présence d'un vaisseau en perdition, qui est en train de sombrer dans l'atmosphère de cette étoile...

L'amiral Forrest est contacté par l'ambassadeur vulcain Soval, qui lui fait part de la destruction par les Andoriens du sanctuaire de P'Jem. Soval accuse le capitaine Archer d'y être mêlé et d'avoir indiqué aux Andoriens la cachette du lieu sacré. Mais Archer clame son innocence à qui veut bien l'entendre...

Quelques problèmes techniques sur le vaisseau Enterprise nécessitent le réglage des radars de visée. Pour ce faire, Reed et Tucker doivent emmener une navette assez loin du vaisseau. Les deux officiers embarquent alors à bord de la navette n°1 et se dirigent vers leur destination. Pendant ce temps, l'Enterprise est immobilisé au milieu d'un champ d'astéroïdes...

Alors que le capitaine Archer montre à T'Pol un livre d'astronomie, Reed annonce l'approche d'un navire alien. T'Pol reconnaît imédiatement le vaisseau, il s'agit d'un vieux modèle vulcain qui n'est plus en service. C'est alors que Tavin, le capitaine de ce navire étranger, demande à Archer l'autorisation d'effectuer des réparations...

L'Enterprise arrive à proximité d'une planète qui a quitté l'orbite de son soleil. Elle est plongée en permanence dans l'obscurité mais semble habitable. Très rapidement, les détecteurs y décèlent la présence en surface d'un vaisseau inconnu, lequel ne répond pas aux appels du capitaine Archer...

Le vaisseau est visité par deux pirates aliens, des Ferengi, qui ont réussi à propager un gaz dans l'appareil, plongeant l'équipage dans l'inconscience. Les deux individus fouillent tous les recoins en quête d'objets de valeur. C'est compter sans Tucker, placé en chambre de décontamination, et ainsi protégé du gaz. Tucker tente alors de monter à bord du vaisseau des pirates et réveille T'Pol, tandis que les aliens ont réanimé Archer et exigent de lui qu'il les mène jusqu'à son or...

T'Pol, Tucker et Archer dînent avec un marchand alien, D'Marr. Le capitaine, qui a besoin de trouver du Duratanium pour réparer la coque du vaisseau, demande à D'Marr où il peut en trouver. Celui-ci indique au capitaine un endroit où se trouve l'épave d'un vaisseau, mais il le met en garde car le navire serait hanté...

Alors qu'ils explorent une planète inconnue, Mayweather et Archer se réveillent dans une prison, ignorant totalement comment ils y sont arrivés. La porte de leur cellule est ouverte et bientôt un gardien les mène devant le directeur de l'endroit, qui leur explique qu'ils sont détenus par erreur dans cet endroit. Les membres de l'équipage de l'Enterprise apprennent alors qu'ils se trouvent sur une planète occupée par les Tandarans, actuellement en guerre conre les Sulibans. Or les Sulibans ont déjà eu des contacts avec les Terriens et leur ont, par le passé, fait plusieurs fois la guerre...

L'équipage de l'Enterprise tente un premier contact avec un peuple encore inconnu, les Kreetassens, mais suite à une incompréhension, c'est un échec cuisant. Un peu plus tard, une créature quitte le vaisseau extraterrestre et pénètre dans l'Enterprise. Il s'agit d'un symbiote, qui capture plusieurs membres de l'équipage et les enveloppe dans des cocons...

Cela fait maintenant un an que l'Enterprise a quitté la Terre. La fatigue se fait ressentir au sein de l'équipage et T'Pol propose de faire une halte sur la planète Risa, afin de se reposer. Mais ces vacances sont contrariées par un appel urgent de Starfleet qui confie à Archer la mission délicate de rapatrier un ambassadeur vulcain, actuellement en poste sur la planète Mazar. L'Enterprise prend aussitôt le cap de cette planète isolée. En chemin, Archer se familiarise avec le dossier de l'ambassadeur qu'il devra embarquer. Il découvre que le diplomate a été victime d'un complot destiné à le discréditer...

En route pour Risa, le capitaine Archer reçoit un message de détresse d'un vaisseau alien. L'équipage vient en aide à son occupant, Zobral, qui, reconnaissant, propose d'accompagner l'équipage sur sa planète désertique...

Après bon nombre de contretemps et rebondissements, l'Enterprise parvient enfin à se positionner en orbite autour de la planète des plaisirs, Risa. Des négociations fixent qui doit rester à bord du vaisseau et finalement, Archer, Sato, Mayweather, Tucker et Reed embarquent à bord d'une navette et se rendent sur la planète. Ils ignorent tout de ce qui les attend. Archer rencontre une mystérieuse extraterrestre et Sato passe une soirée romantique. Mayweather est victime d'un accident alors qu'il faisait de l'escalade pendant que Trip et Reed passent la nuit à faire la fête. Avec de lourdes conséquences...

Le capitaine Archer propose à l'équipage d'aller rendre visite à une colonie minière. Mais lors de leur atterrissage, le plasma dégagé par les réacteurs provoque une onde de choc et détruit la colonie. Depuis la catastrophe, Archer et Daniels sont coincés dans une autre dimension temporelle, le 31e siècle. Ils découvrent alors un avenir terrifiant pour l'humanité, miné par la misère au sein de ruines. La vie sur Terre n'est que désolation. Archer comprend le rôle qui lui est imparti au 22e siècle, pour éviter la réalisation de ces événements. Les Sulibans montent alors dans l'Enterprise...

Après la disparition du vaisseau du capitaine Archer lors d'une mission, Silik et ses soldats, des Sulibans, montent à bord de l'Enterprise. Pendant ce temps, Daniels et Archer sont coincés dans une autre dimension temporelle, après l'incident qui les a propulsés au XXXIe siècle. Ils sont alors les témoins impuissants d'un avenir sombre pour l'humanité, fait de misère et de ruines, sur une Terre dévastée. Aussi leur faut-il trouver d'urgence un moyen de retourner dans leur époque, pour empêcher le déroulement de ces sinistres événements. Leur rôle est crucial pour le futur de la planète...

Archer et Trip se posent des questions à propos de la visite qu'a rendu T'Pol aux habitants d'une ville minière de Pennsylvanie nommée Carbon Creek. T'Pol leur explique alors, avec force détails, la véritable histoire du premier contact entre les humains et la race extraterrestre des Vulcains, qui eut lieu en 1957 à cet endroit. En effet, sa grand-mère faisait partie des survivants de l'équipage d'un vaisseau qui s'est écrasé à Carbon Creek. Son témoignage est donc des plus sûrs. Mais le commandant de l'Enterprise n'a pas connaissance de cette version, absente des livres d'histoire des Terriens...

L'équipage de l'Enterprise a localisé une planète inconnue et se propose de l'explorer. Alors que le vaisseau vient de pénétrer dans le champ orbital de la planète, une succession d'explosions inexplicables endommage l'appareil. Plusieurs membres à bord souffrent de blessures. Archer et ses collègues constatent l'étendue des dégâts et tentent de déterminer l'origine du dommage. Il semblerait que cette zone soit truffée de mines. L'une d'entre elles se trouve désormais dans l'Enterprise. Malcolm Reed doit la désamorcer d'urgence...

Près d'une planète inconnue, un champ de mines a provoqué des explosions à bord du vaisseau. Archer et ses collègues tentent de réparer les dégâts les plus urgents. Le capitaine décide alors de faire escale dans une station spatiale mystérieuse. Doté d'un équipement technologique sophistiqué des plus impressionnants, l'endroit est idéal pour y effectuer cette tâche. Aussi les réparations sur l'Enterprise sont-elles rapidement exécutées, grâce au robot qui dirige les opérations. L'absence d'une présence humaine intrigue Archer, qui constate bientôt qu'il y a un prix à payer pour le service rendu...

Les négociations du capitaine Archer et d'un peuple extraterrestre au sujet d'un injecteur de plasma, nécessaire pour l'Enterprise, semblent mal parties. Frustré, Archer rentre au vaisseau où l'attend une mauvaise nouvelle. Porthos, son fidèle compagnon, serait atteint d'un virus mortel. Par précaution, le chien a été mis en quarantaine. Le docteur Phlox fait tout pour sauver son système immunitaire, altéré par la maladie. Archer découvre également les raisons des réticences de ses interlocuteurs aliens : son chien aurait uriné contre un arbre centenaire appartenant au patrimoine de cette planète...

L'Enterprise commence à manquer de réserves en deuterium, qui alimente ses puissants réacteurs. Archer décide de se rendre dans une colonie Kreetassienne, dans l'espoir de pouvoir s'approvisionner dans une mine locale. Il entre en négociation avec le chef des colons, Tessic, qui accepte avec réticence de leur céder du deuterium en échange de leur aide. Alors que l'équipe d'Archer les seconde dans des réparations de matériel, Tessic et ses collègues sont alarmés par l'arrivée d'un vaisseau extraterrestre. Korok, l'ambassadeur des Klingons, fait pression sur les colons pour obtenir du combustible...

Archer, T'Pol et Mayweather sont en voyage dans le monde arctique pour y appréhender un fugitif. Après avoir été contactée par le gouvernement des Vulcains, T'Pol se voit contrainte de révéler à son capitaine ses activités passées d'agent secret. Les Vulcains souhaitent en effet lui confier une mission des plus dangereuses. Il faut qu'elle retrouve un ancien criminel, qui a toujours réussi à passer entre les mailles du filet. Lorsque les souvenirs de son échec passé viennent hanter T'Pol, ses compagnons d'équipage comprennent qu'elle est en difficulté. Ils volent alors à son secours...

Après avoir effectué une mission sur une planète, Reed se rend compte qu'il a oublié sur place un communicateur, acte lourd de conséquences pour la population locale. Aux côtés d'Archer, il retourne sur place afin de récupérer l'appareil au plus vite, avant qu'il n'interfère avec la culture «pre-warp». Malheureusement pour eux, ils sont capturés et se retrouvent au centre d'un conflit entre deux camps. Pendant ce temps, Trip et Mayweather font tout leur possible pour rapatrier leurs compagnons. A cette occasion, ils vont tester la technologie de camouflage employée par les Sulibans...

L'Enterprise se dirige vers un trou noir inhabituel, afin d'étudier ce phénomène. En cours de route, l'équipage se livre à différentes tâches. Alors que le capitaine se concentre sur la rédaction d'une préface, Reed travaille sur un nouveau système de sécurité. Progressivement, un mal étrange s'empare des différents membres du vaisseau, qui semblent de plus en plus tendus et irritables. Seule T'Pol semble épargnée. D'Archer au docteur Phlox, tous sombrent dans une forme d'obsession du travail, refusant de se détourner de leur tâche en cours. T'Pol essaie de comprendre pourquoi...

En mission sur une planète, Hoshi Sato et Trip s'interrogent sur les raisons de la disparition de la civilisation qui y habitait. Prenant des clichés des ruines, ils tentent de percer ce mystère. Cependant, en raison d'un risque de tempête, Archer leur demande de retourner immédiatement au vaisseau. Une fois de retour, Hoshi est prise d'un mal étrange et en parle au docteur Phlox. Archer a recours aux dons d'Hoshi pour déchiffrer une langue extraterrestre, afin de délivrer Mayweather, pris en otage. Peu après cette mission, Hoshi a la troublante sensation de se dématérialiser et se téléporte involontairement...

Alors que l'Enterprise vient de recevoir un signal de détresse d'un vaisseau Retellien, Trip monte à bord du navire afin d'aider ces étrangers à réparer l'avarie. Il est emmené dans une chambre de stase, où une très belle femme, du nom de Kaitaama, est maintenue en suspension. Soudain, elle se réveille accidentellement de son sommeil artificiel. Trip a la surprise d'apprendre qu'elle n'est pas une passagère mais une prisonnière, détenue dans cette cellule spéciale. Le commandant est ému par cette révélation et tombe sous le charme de la jeune femme. Il décide de la sortir des griffes de ses ravisseurs...

L'Enterprise est pris au piège d'une impressionnante tempête ionique, aux radiations mortelles. Le seul endroit susceptible de protéger l'équipage de ce danger se trouve dans les nacelles de distorsion du vaisseau, équipées d'un blindage renforcé. Tous s'y précipitent pour se protéger des ondes cosmiques. Mais ils sont bientôt sollicités par un groupe d'extraterrestres déroutés qui leur demandent de les héberger. Cependant, le commandant et sa troupe s'aperçoivent bientôt de la malhonnêteté de ces étrangers, en vérité insensibles aux radiations, qui tentent de voler le matériel de bord...

Archer doit collaborer avec une force militaire arkonienne. Or, d'après les Vulcains, les Arkoniens seraient une race extrêmement brutale. Le but du capitaine est de secourir Trip, dont le vaisseau s'est écrasé sur une lune après un combat contre une navette arkonienne. Trip et son ennemi, qui s'est lui aussi écrasé, ont uni leurs forces pour se construire un abri sur cette planète inconnue et, a priori, hostile. Soudain, le jour se lève : le soleil darde des rayons meurtriers, tellement forts que Trip et son compagnon d'infortune doivent trouver rapidement une solution s'ils veulent réussir à survivre...

L'Enterprise visite une planète sur laquelle se déroule une importante conférence médicale. Le docteur Phlox essaye de soutirer des informations à la délégation vulcaine. Il voudrait en effet que les Vulcains lui livrent des informations sur le syndrome de Pa'an, une maladie extrêmement dangereuse dont est visiblement atteinte T'Pol. Phlox sait que s'il révèle que T'Pol est malade, il sera immédiatement mis au ban de la société vulcaine. En effet, le syndrome de Pa'an vaut aux personnes infectées d'être impitoyablement écartées. Pendant ce temps, une des trois épouses de Phlox monte à bord du vaisseau pour aider Trip à installer un microscope à neutrons...

Les Vulcains et les Andorians menacent de guerre une petite planète globalement inoffensive, dans le but de s'emparer de ses richesses et d'en faire une base stratégique. Le conflit éclate rapidement et Shran vient chercher Archer de toute urgence pour qu'il l'aide à instaurer un cessez-le-feu entre les deux peuples ennemis. Mais bientôt, un groupe de rebelles andoriens attaquent l'Enterprise, faisant voler en éclats la précieuse neutralité de l'équipée. La situation, extrêmement tendue, ne laisse qu'une marge de manoeuvre réduite à Archer et à ses hommes...

L'Enterprise trouve une petite embarcation à la dérive. Celle-ci, à sa grande surprise, contient un corps humain. De nouvelles questions vont rapidement se poser lorsque les Sulibans et les Tholians feront des déclarations sur le vaisseau en question...

Alors qu'ils tentaient d'établir un premier contact avec les Enoliens, le capitaine Jonathan Archer et le commandant Charles Tucker sont arrêtés et jetés à bord d'un vaisseau de prisonniers qui se rend sur la colonie pénitentiaire de Canamar. Celle-ci, réputée inviolable, pourrait bien constituer leur destination finale. Comment faire pour s'évader ? La question tourne inlassablement dans leur esprit. Leurs compagnons pourraient-ils leur être d'un quelconque secours ? Les deux hommes craignent de ne pouvoir compter que sur eux-mêmes pour sortir de cette position des plus fâcheuses...

Suite à une attaque menée par des aliens, les membres de l'équipage de l'Enterprise semblent agir étrangement, comme s'ils étaient possédés...

Le capitaine Jonathan Archer est dans de sales draps : il est accusé d'avoir aidé une colonie rebelle klingonne et se retrouve devant un tribunal. Son avocat tente par tous les moyens de prouver son innocence afin de lui éviter au pire la peine de mort, au mieux de passer le restant de ses jours sur la colonie minière. Un peu plus tard, alors qu'il croupit dans sa cellule, Archer reçoit la visite de Phlox qui l'informe que l'appareil diplomatique s'est mis en branle dans le but de l'aider. Mais Archer ne semble préoccupé que par une seule chose : la sécurité de l'Enterprise. Il demande des nouvelles de T'Pol...

Mayweather retrouve sa famille à bord du vaisseau cargo Horizon. Il apprend le décès de son père et la reprise du commandement du vaisseau par son frère, Paul. Il est très inquiet lorsqu'il découvre que des aliens, qui les ont déjà attaqués, ont placé à bord du cargo un mouchard impossible à désactiver, en prévision de nouvelles attaques...

Le commandant Trip Tucker, le lieutenant Malcolm Reed et Travis Mayweather partent récupérer trois géologues dénobuliens expulsés d'une planète à la suite d'un coup d'Etat. Mais les scientifiques ne veulent pas partir et abandonner ainsi leurs recherches, le fruit de nombreuses et longues années de travail. Parallèlement, les membres de l'équipage doivent porter secours à des blessés Antarans et les transportent à bord du vaisseau. Malheureusement, certains d'entre eux refusent les soins du docteur Phlox et s'exposent ainsi à de terribles dangers...

L'équipage de l'Enterprise entre en contact avec les Vissians, une espèce qui comprend trois genres. Trip rencontre l'un d'entre eux, celui des co-géniteur. Il se rend compte alors que ceux-ci sont traités très durement par les Vissians...

Des scientifiques découvrent dans le cercle arctique les restes d'une sphère borg, celle de First Contact, et, en s'intéressant d'un peu trop près à la nanotechnologie régénératrice, encore inconnue sur Terre, ils se font assimiler un par un. Les Borgs réveillés repartent alors dans l'espace et assimilent un autre vaisseau. L'Enterprise, alerté par la Terre, les intercepte mais c'est Phlox qui se fait alors assimiler. Il faut trouver une solution au plus vite...

En explorant une nébuleuse sombre, Archer reçoit la nouvelle de la mort de son vieux rival du programme spatial Robinson. Il raconte alors à T'Pol les événements entourant les premiers tests du moteur à distorsion 2 et la course à celui qui franchirait le premier la barrière de distorsion 2. Quand le vol d'essai échoua et que le vaisseau fut détruit, Archer et le jeune Trip Tucker, qui travaillait sur le projet, refirent un nouveau vol d'essai en lançant le NX-Beta sans l'aval de Starfleet...

Alors qu'il semblait a priori inoffensif, Skalaar, un chasseur de primes qui travaille pour les Klingons, kidnappe le capitaine Archer et met en péril l'Enterprise en sabotant les circuits du vaisseau. Skalaar fomente le projet de rencontrer Goroth afin de demander une importante rançon pour libérer Archer. Mais l'équipage a tôt fait de réparer l'Enterprise et il se met aussitôt en route pour retrouver Archer au plus vite. De son côté, Skalaar est à son tour victime d'un autre chasseur de primes...

Le chancelier Klingon laisse à Duras une dernière chance de récupérer Archer. L'Enterprise est attaqué mais parvient à échapper aux griffes des Klingons, grâce à l'intervention de renforts envoyés par Starfleet. De retour sur Terre, l'équipage découvre que la planète a été sauvagement attaquée...

Six mois après avoir débuté, la nouvelle mission de l'Enterprise est toujours au même point : elle n'a fait aucun progrès, même virtuellement. C'est alors que le capitaine Jonathan Archer apprend l'existence d'un travailleur xindi dans une colonie minière. C'est leur seul espoir d'en apprendre un peu plus sur la race extraterrestre qui a attaqué la Terre. Mais il pourrait également bel et bien s'agir d'un piège...

En route pour la cité minière, le vaisseau Enterprise est confronté à de mystérieuses perturbations spatiales avant d'être attaqué par des pirates osaariens qui s'emparent de leurs précieuses réserves...

En mission pour inspecter un vaisseau xindi abandonné sur une planète de jungle tropicale, Archer, Reed et Hoshi succombent à un virus qui mute leurs corps et leurs esprits en une forme de vie primitive, en fait celle des habitants depuis longtemps éteints de l'astre. T'Pol, elle, semble être bien portante. Phlox entame alors une course contre la montre pour trouver un antidote qui sauverait la vie de ses collègues. C'est alors qu'un groupe d'aliens, qui ne semblent pas vraiment inoffensifs, atterrit sur la planète...

Sauvée par Archer d'un marché alien, une superbe esclave nommée Rajiin utilise ses pouvoirs hypnotiques érotiques sur l'équipage pour soutirer des informations aux humains pour le compte de ses maîtres xindis. Mais quand sa duperie est découverte, Archer la jette en cellule, forçant les Xindis reptiles à attaquer le vaisseau, toutes armes dehors, pour la libérer. Pendant ce temps, Trip et T'Pol entament une opération risquée pour protéger le vaisseau de nouvelles destructions causées par les étranges phénomènes physiques de l'étendue delphique...

En accostant un vaisseau vulcain endommagé à la dérive dans un champ d'astéroïdes, Archer et son équipage découvrent que les survivants ont muté en des créatures violentes. Quand T'Pol commence à se conduire bizarrement et à montrer à son tour les signes de la mutation, la course contre la montre s'engage pour ne pas perdre l'une des leurs pour toujours. Pendant ce temps, Trip et Mayweather essaient d'extraire du trellium d'un astéroïde. Mais la tâche n'est pas facile...

A des années-lumière de distance, un puissant alien télépathe, Tarquin, contacte mentalement Hoshi pour convaincre Archer de laisser l'Enseigne venir faire une courte visite sur sa planète isolée en échange d'informations cruciales sur les Xindis...

Arrivés sur une colonie xindi, Archer, Reed et le major Hayes partent en reconnaissance dans une entreprise d'armements. Ils interrogent le responsable, un dénommé Gralik, et découvrent que celui-ci n'est pas au courant de l'attaque terrestre. Surpris que la planète bleue ait été victime de l'ambition de ses ennemis, Gralik décide immédiatement de ralentir la production d'armes, ce qui n'est pas pour déplaire à Archer. Parallèlement, Trip et Phlox commencent à examiner une arme xindi, qui ressemble fort à un reptile...

Une distorsion spatiale laisse Archer sans aucune mémoire à long terme. Plusieurs années plus tard, il se réveille un matin et est abasourdi de découvrir la tournure prise par le conflit entre la Terre et les Xindis...

Archer, Trip et T'Pol se rendent sur une planète peuplée d'humains vivant comme au temps du Far West et découvrent que ces derniers, amenés en ces lieux pour servir d'esclaves il y a plus de 300 ans, se sont rebellés et sont devenus les nouveaux maîtres, infligeant aux Skagarans les pires humiliations, des lois injustes et des traitements indignes. L'Enterprise doit décider s'il faut ou non intervenir. Quand la décision est prise, la civilisation, qui jusque-là n'avait besoin de personne, est au bord de la crise...

Lors d'une manoeuvre pour optimiser la puissance du navire, Trip est sérieusement blessé et le vaisseau endommagé. Le docteur Phlox crée alors un symbiote dont le tissu nerveux pourra être transplanté sur l'invalide. Baptisé Sim, le clone a une durée de vie limitée et surprend l'équipage avec des souvenirs que seul Trip pouvait avoir...

Archer reçoit la visite de Daniels, qui lui apprend que trois Xindi-Reptiles se trouvaient dans le Michigan, à proximité de Detroit, au début du XXIe siècle. Archer et T'Pol décident de faire un saut dans le passé afin de découvrir la raison de leur voyage temporel. Ils découvrent que les Reptiliens utilisent une vieille usine et qu'un homme, répondant au nom de Loomis, travaille pour eux, kidnappant des humains pour leurs expériences. Archer et T'Pol comprennent que leurs ennemis mettent au point une arme biologique nouvelle et que leurs recherches sont presque achevées. Il est temps d'intervenir...

Après avoir sauvé l'équipage d'un vaisseau triannon en détresse, les hommes de l'Enterprise découvrent que les naufragés sont tous des fanatiques religieux, menés par un certain D'Jamat. Ce dernier ne tolère pas d'autre foi que la sienne et menace de détruire l'Enterprise. Archer tente de le calmer, mais se retrouve contraint d'emmener D'Jamat et ses hommes vers leur monde natal...

En mission pour détruire le prototype de l'arme suprême xindie, le vaisseau Enterprise est confronté à un champ d'anomalies spatiales où il s'est engagé pour aller plus vite. Les fâcheuses conséquences de ce geste inconsidéré ne se font pas attendre : le vaisseau est sérieusement accidenté. Sous le commandement de Shran, un navire andorien lui porte secours et décide de s'allier à lui contre les Xindis. Mais les stratégies diffèrent et, bientôt, rien ne se passe comme prévu...

Le capitaine Archer attire le Xindi Degra dans un piège afin de lui faire avouer le lieu de fabrication de l'arme suprême...

27 décembre 2153. L'Enterprise se porte au secours d'un alien pris au piège dans son vaisseau à l'intérieur d'une grosse anomalie gravitationnelle volatile. Mais l'alien décède malheureusement à l'infirmerie en refusant de révéler ce qu'il cherchait dans cette anomalie. Pendant ce temps, le major Hayes initie les équipes de sécurité et les officiers supérieurs à de nouvelles techniques de combat, s'attirant ainsi la colère de Malcolm Reed. Quant à Trip, il tisse des liens très intimes avec l'une des membres de la force MACO...

Se rendre sur le système Azati Prime est beaucoup plus hasardeux que ce que le capitaine Archer présumait. Le vaisseau doit faire face à d'importantes perturbations gravitationnelles qui prendraient plusieurs semaines pour les contourner. Archer décide donc d'autoriser Phlox à plonger l'équipage dans un coma artificiel. Mais, bientôt, alors que l'Enterprise semble être pris au piège de cette zone dangereuse, Phlox souffre d'étranges hallucinations...

8 janvier 2154. L'Enterprise découvre un vaisseau xindi-insectoïde écrasé sur une petite planète perdue, tout son équipage mort. Après enquête, Archer et les siens découvrent qu'ils ne sont pas décédés dans l'accident mais se sont intentionnellement tués par suffocation afin que tout le support vital du vaisseau soit transféré à la chambre d'incubation qui contient plusieurs dizaines d'oeufs xindi-insectoïdes. Ces derniers tentent d'éclore, mais le support vital s'effondre. Archer semble déterminé à aider les nouveau-nés à survivre...

L'Enterprise arrive près d'Azati Prime, où la super arme xindi destinée à détruire la Terre est en phase finale de construction. L'équipage en localise la structure massive sous l'océan, mais réalise que sa destruction ne pourra se faire qu'au prix d'une mission suicide. Archer insiste pour le faire lui-même. Mais Daniels apparaît et emmène Archer 400 ans dans le futur. Là, il lui dévoile une conspiration de cette époque qui est la cause première du déclenchement de la guerre entre humains et Xindis...

Après avoir torturé Archer, les Xindis le renvoient de manière inattendue sur l'Enterprise, lequel n'est plus que ruines après l'attaque dévastatrice des Reptiliens. Le capitaine est informé que certains membres du Conseil mieux intentionnés voudraient le rencontrer. Mais le rendez-vous fixé à quelques jours se situe à plusieurs années-lumière. Avec un vaisseau presque détruit, sans distorsion, et avec de nombreux membres d'équipage morts ou blessés, Archer met de côté son éthique dans une tentative désespérée pour remettre en état son vaisseau. Pendant ce temps, T'Pol demande discrètement l'aide du Docteur Phlox en lui révélant un étonnant secret qui lui pèse depuis plusieurs mois...

Après les dommages subis par l'Enterprise et la mort d'un cinquième membre de l'équipage, le vaisseau parvient tant bien que mal à rejoindre l'une des mystérieuses sphères métalliques pour y rencontrer clandestinement Degra. Archer tente de lui prouver, ainsi qu'à un scientifique membre arboricole du Conseil xindi invité à bord, qu'ils ont été manipulés par les Insectoïdes...

Durant leur trajet pour rencontrer le Conseil xindi, Archer et son équipage rencontrent un NX-01 jumeau piloté par leurs descendants. Ceux-ci sont venus les alerter que le raccourci subspatial qu'ils s'apprêtent à emprunter les enverra cent ans dans le passé, assurant du coup la destruction de la Terre. Il s'agit de faire en sorte que l'histoire ne se répète pas : Lorian a l'intention d'augmenter la vitesse du vaisseau, mais le descendant d'Archer n'est pas d'accord avec cette option. Bientôt, Archer doit prendre une importante décision...

Archer approche le Conseil xindi pour tenter de convaincre Degra et ses compagnons de faire la paix et de neutraliser l'arme qu'ils s'apprêtent à utiliser. Pendant ce temps, T'Pol, Reed, Mayweather et un commando MACO infiltrent une Sphère afin de récolter des informations sur ses constructeurs, une mission beaucoup plus périlleuse que prévu...

13 février 2154. Avec l'aide de ses alliés xindis, l'équipage de l'Enterprise lance un assaut final pour tenter d'arrêter l'arme de destruction planétaire pointée sur la Terre par les rebelles xindis-insectoïdes et reptiliens, avant que Hoshi, kidnappée et convertie, ne décode la combinaison de mise à feu et ne détruise la Terre. Pendant ce temps, T'Pol et Trip élaborent un plan pour détruire une sphère censée contrôler l'ensemble du réseau de Sphères, ce qui annulerait les anomalies de l'Etendue Delphique et révélerait leurs mystérieux constructeurs au grand jour...

14 février 2154. Alors qu'ils arrivent en vue de la Terre, Archer, Hoshi, Reed et une petite équipe, avec l'aide des Xindis arboricoles et humanoïdes, continuent leur course contre la montre pour intercepter la super arme en cours de charge et la désarmer de l'intérieur du vaisseau reptilien. Pendant ce temps, T'Pol et l'Enterprise tentent de désactiver une Sphère clé dans le but de mettre à jour les constructeurs interdimensionnels. Mais dans un ultime retournement, ces derniers renversent le cours de l'Histoire...

Le vaisseau Enterprise s'est fait projeter dans le passé et l'équipage se retrouve au coeur des événements de 1944. Les aventuriers de l'espace doivent bientôt stopper une guerre froide déclenchée par des extraterrestres, et préserver le cours de l'Histoire, ce qui n'est évidemment pas de tout repos...

Les pionniers de l'espace Archer et Silik sont projetés en 1944 et doivent retrouver les agents temporels qui ont changé le cours de l'Histoire et la fin de la Seconde Guerre mondiale. Ils pourront peut-être ainsi empêcher la destruction du cours du Temps...

L'Enterprise revient sur Terre où son équipage est accueilli en grandes pompes. Mais une enquête est tout de même ouverte sur l'attaque xindi. Tucker, qui n'a plus de foyer dans la Floride détruite, accepte l'invitation de T'Pol sur Vulcain pour y rencontrer sa mère. Mais T'Les, la mère de T'Pol, a organisé le mariage de sa fille avec son prétendant vulcain, Koss...

17 mai 2154. L'Enterprise croise le chemin d'Arik Soong, un scientifique obsédé par la création de supersoldats appelés «Améliorés». Croyant que les modifications génétiques sont l'avenir, il ravive vingt embryons des guerres eugéniques...

Archer sauve Smike, un Amélioré trompé sur Trialas Quatre par ses amis surhommes. Phlox découvre que Smike est défectueux, victime d'une expérience génétique qui a échoué. Contrairement aux autres, il n'a aucun super pouvoir. L'ancêtre du créateur de Data ne maîtrise plus du tout les créatures qu'il a créées à partir des surhommes des guerres eugéniques...

Une guerre interstellaire risque d'éclater si les Améliorés continuent à se rebeller contre leur créateur. En effet, ces êtres modifiés sont en train de fomenter des plans contre les Klingons...

L'ambassade vulcaine sur Terre est détruite par une explosion, tuant trente-et-un humains et douze vulcains. L'Enterprise est dépêché sur Vulcain pour enquêter, mais le Haut Commandement suspecte déjà une faction religieuse, les Syrrannites, d'être les responsables de l'attentat. T'Pol apprend alors de son mari, Koss, que sa mère, T'les, s'est enfuie pour ne pas être arrêtée...

Après leur périlleuse traversée du désert vulcain, Archer et T'Pol localisent finalement les Syrrannites, la faction révolutionnaire accusée de l'attentat contre l'ambassade de la Terre...

Les Vulcains et les Andoriens se livrent à des combats militaires impitoyables. Cependant, les aventuriers du vaisseau Enterprise sont chargés d'une mission délicate. Ils doivent rapporter un Artefact sacré, qui renferme des écrits du maître vulcain Sirak concernant un conflit religieux interne. Mais l'ordre a été donné d'empêcher Archer, T'pau et T'Pol de mener à bien leur périlleuse mission...

Emory Erickson, le créateur du téléporteur, se rend à bord du vaisseau Enterprise pour y réaliser sa dernière expérience qui s'avère être dangereuse...

Un groupe d'extraterrestres non corporels étudie l'équipage de l'Enterprise atteint par un virus mortel rapporté à bord lors d'une mission d'exploration. Les rumeurs soutiennent que ces êtres seraient les Organiens, ceux-là même qui forceront un siècle plus tard la Fédération et les Klingons à cesser leur guerre...

La Terre se porte volontaire pour servir de médiatrice dans un conflit entre les Tellarites et les Andoriens. L'Enterprise doit accueillir la délégation Tellarite, menée par le plutôt rustre ambassadeur Gral, jusqu'aux pourparlers de paix sur Babel Première...

Archer monte une alliance entre Andoriens, Tellarites et Vulcains pour démasquer le vaisseau solitaire qui les harcèle. Bien sûr, ils ne savent pas que ce vaisseau est Romulien. Pendant ce temps, Reed et Tucker, toujours coincés à l'intérieur de l'engin, se retrouvent en danger de mort...

A l'occasion de sa visite sur Andor lors des tensions mêlant Andoriens et Tellarites, Archer fait la connaissance des Aenars, une race aveugle et télépathe qui habite les caves gelées du sous-sol d'Andor et qui partage la planète avec les Andoriens...

Une mystérieuse peste cause des ravages à travers tout l'Empire Klingon. Un groupe de Rigeliens attaque l'Enterprise, de retour sur Terre pour assister au lancement officiel du NX-02, sous le commandement du capitaine Erika Hernandez, et enlève Phlox, afin de travailler sur un remède pour les Klingons. Et l'on découvre enfin pourquoi les Klingons de l'époque de Kirk, un siècle plus tard, n'ont pas ces protubérances crâniennes qui les caractérisent...

Phlox, enlevé par les Klingons, trouve un vaccin contre la peste qui sévit dans l'Empire, mais qui laissera des traces visibles. Pendant ce temps, la tension monte avec les Terriens, qui amènent en renfort de l'Enterprise le NX-02 Columbia, commandé par le capitaine Erika Hernandez...

27 décembre 2154. Trois esclaves Orionnes sont données au capitaine Archer en échange de négociations avec le Syndicat d'Orion. Elles sèment la pagaille au sein de l'équipage, qui ne sait plus où donner de la tête. Pendant ce temps, la relation entre Trip et T'pol prend une nouvelle tournure...

Bozeman, Montana, 5 avril 2063. Le premier contact des Terriens avec des extraterrestres, en l'occurence de pacifiques Vulcains venus saluer les nouveaux voyageurs intersidéraux, a lieu...

L'Entreprise impérial vole le USS Defiant, un vaisseau incroyablement perfectionné. Avec l'aide de l'amiral Black, qui commande l'Avenger, et de son premier officier, le subversif Vulcain Soval, le commandeur Archer de l'Entreprise Impérial capture son malheureux équipage et le torture. Ce vaisseau puissant sera-t-il la clé de son ascension au pouvoir ?

Les ambassadeurs des différentes planètes, avec lesquelles les Terriens entretiennent désormais des relations diplomatiques, se réunissent sur Terre afin de tenter de monter une coalition de planètes. Ils espèrent ainsi lutter ensemble contre les ennemis qui les guettent régulièrement...

Les ambassadeurs aliens, réunis sur Terre sur l'invitation du président de la Terre Nathan Samuels pour créer une coalition de planètes, prennent peur devant la montée xénophobe des Terriens. Sous la direction de Paxton, un adepte du monstrueux colonel Green, ils menacent de plus en plus les aliens. Starfleet Command est en danger...

Troi et Riker profitent du holodeck de l'Enterprise du XXIVe siècle pour se remémorer les grands moments du premier vaisseau intersidéral de Starfleet appelé Enterprise, de son premier équipage et de son célèbre capitaine Jonathan Archer, depuis son voyage inaugural jusqu'à la création de la Fédération...