À Miami en Floride, le jeune Dexter Morgan est tiraillé entre son avenir prometteur et des pulsions de tueur qu'il ressent en lui. Son père, Harry, un policier, comprend que son fils possède des prédispositions à tuer. Il va tenter de canaliser ses instincts meurtriers et lui enseigne certaines valeurs…

Dexter doit trouver ses marques dans son nouveau stage au sein du département de médecine légale du Miami Metro alors qu'Harry reprend le travail après son arrêt maladie. Par ailleurs, Deb se rebelle contre son père en se comportant comme une délinquante…

Aaron Spencer publie un communiqué sur l'affaire de l'enlèvement du jeune Jimmy. Les forces de l'ordre promettent de résoudre ce cas. L'inspectrice Maria LaGuerta fait son arrivée, ce qui provoque quelques remous au sein de l'unité criminelle. Dexter commence à s'intéresser au personnage de Tony Ferrer…

La police criminelle de Miami est appelée sur une scène de crime. Les inspecteurs découvrent le corps du jeune Jimmy, pendu à proximité d'un pont. Dexter est perturbé par cette macabre nouvelle. Harry tente de le réconforter et l'affecte à une autre affaire sur laquelle travaille Maria LaGuerta…

Dexter retourne à la maison de Mad Dog avant que la police ne débarque pour effacer les traces de son passage. Mais ce coup de pression ne passe pas inaperçu. Harry, le père de Dexter, décide de recadrer les pulsions de son fils. Il l'encourage à ne plus se lancer dans des initiatives risquées...

Après des appréciations des supérieurs de la police, on demande à Harry de travailler avec Maria LaGuerta. Les enquêteurs se plongent dans une affaire de meurtre. Dexter apporte son expertise. Il suggère que le meurtre est lié à d'autres crimes antérieurs, bien qu'ils aient tous été assassinés de manière différente...

Dexter est parfois à la limite en transportant le cadavre de Levi Reed. Plus tard, Vince Mazuka lui demande de relever les empreintes digitales d'un bras coupé, dont Dexter déduit qu'il s'agit de celui de Tony Ferrer. Sachant que cela pourrait mener la police à lui, Dexter jette le bras dans un marais...

Dexter se confie à son père Harry. Il lui dit qu'il soupçonne Aaron Spencer d'avoir enlevé Nicky, son propre fils. Mais Harry ne semble pas croire à cette théorie. En revanche, Harry demande à Dexter de rechercher sa soeur Debra, qui apparemment n'est pas rentrée chez elle. En fait, Debra est partie avec Gio...

Après un raid du SWAT qui a mal tourné, Dexter se rapproche de l'auteur du rapt de l'enfant. Pendant ce temps, Deb travaille avec son père et voit la police de Miami sous un nouveau jour. Harry s'intéresse de plus près à l'affaire du tueur en série mais cache sa théorie à LaGuerta...

La police de Miami est secouée par un enlèvement qui la touche de près. Plus tard, Dexter se lance à la poursuite d'un tueur qui est passé à travers les mailles du système judiciaire. Mais d'abord, Dexter doit survivre à un double rendez-vous avec Debra et son nouveau petit ami...