La république de Rome souffre de multiples conflits qui opposent les patriciens et les plébéiens. Deux hommes se partagent le pouvoir : Jules César qui est en train de conquérir la Gaule et Pompée qui tente de maintenir l'ordre dans la ville. Mais l'alliance entre les deux hommes est de plus en plus ténue. En Gaule, l'aigle de César est dérobé, il envoie le légionnaire Vorenus à sa poursuite. Pendant ce temps à Rome, Atia complote pour faire de sa fille Octavia la nouvelle épouse de Pompée.

César envoie Marc-Antoine à Rome pour qu'il négocie avec Pompée les conditions de son retour en Italie. Titus Pullo et Lucius Vorenus lui servent d'escorte. Ce dernier est quelque peu terrifié à l'idée de revoir sa femme, Niobe, dont il est séparé depuis plus de 8 ans. Octavia renoue avec Glabius contre l'avis de sa mère.

César entre en Italie. Il envoie Vorenus et Pullo en éclaireurs pour déterminer l'accueil qui risque de lui être réservé à Rome. Leur avancée est rapide, et Pompée réalise que ses légions ne sont pas prêtes à les combattre. Il décide donc de quitter la ville et d'entamer une retraite stratégique à Cofinium, le temps de regrouper ses troupes...

Le fils de Pompée, Quintus, retourne à Rome pour retrouver l'or qu'ils se sont fait voler. Atia est chargée d'organiser la fête en l'honneur du retour de César et elle compte bien en profiter pour se rapprocher de l'homme qui est maintenant le plus puissant de la ville. Mais c'est sans compter Servilia, qui attend depuis tellement d'années le retour de celui qu'elle aime. Marc-Antoine propose à Vorenus d'entrer chez les evocati comme préfet de premier niveau, mais ce dernier a d'autres projets. Et une question essentielle se pose : les augures seront-elles favorables à César ?

César offre une trève à Pompée qui pour l'instant ne fait que fuir devant l'avancée des légions de son ancien ami. Les esclaves gaulois que Vorenus voulait vendre sont presque tous mort de la dysenterie, il se retrouve donc sans aucun moyen de subsistance et doit reconsidérer la proposition de Marc Antoine. Atia engage Titus Pullo pour enseigner les 'arts virils' à Octave. Elle est aussi profondément agacée par la relation qui lie César à Servilia...

Lyde et Niobe sont inquiètes de la disparition de Pulchio. Atia demande à Pullo de régler la question de la virginité d'Octave. Réalisant que les troupes de Pompée sont supérieures en nombre aux siennes, César demande à Marc Antoine de lui envoyer la 13ème légion...

Poussé par les sénateurs, Pompée décide d'attaquer César, qui attend des renforts. Mais l'infériorité numérique des hommes du maître de Rome développe d'autant leur instinct de survie, et César met l'armée de Pompée en déroute. Rescapés du naufrage qui a englouti la 13ème légion, Vorenus et Pullo attendent leur sort sur l'île où ils ont échoué. Craignant la défaite de César, Atia envoie sa fille Octavia demander la protection de Servilia. Celle-ci accepte, et les deux femmes s'embrassent passionnément.

Ayant poursuivi Pompée jusqu'en Égypte, César arrive à Alexandrie, où il rencontre le jeune roi Ptolémée. Ce dernier évoque auprès de lui la disparition de sa sœur Cléopâtre, avec laquelle le souverain se dispute le trône. Il prétend ne pas savoir où elle se trouve, mais en réalité, il la retient secrètement prisonnière dans le désert. En guise de présent, la cour égyptienne offre la tête de Pompée à César, ce qui déclenche sa fureur : il envoie sur le-champ Vorenus et Pullo à la recherche de Cléopâtre, et la réinstalle sur le trône. Cherchant à éponger les dettes accumulées au fil des ans par l'Égypte, César trouve un moyen tout à fait agréable d'assurer sa succession.

La mort des derniers sénateurs dissidents sonne le retour triomphal de César au pays. Vorenus retrouve Niobé, et Pullo conte fleurette à Eirene, la jeune esclave qu'il avait libérée du joug ennemi quelques années auparavant. Atia organise un dîner pour célébrer la victoire de César. Servilia et Brutus y assistent, ainsi qu'Octave, à qui César offre une place de pontife. Gardant toujours rancune à César de l'avoir répudiée, Servilia utilise Octavia pour obtenir des informations compromettantes sur le tyran,sans se douter du terrible châtiment que lui réserve Atia.

Proclamé empereur à l'unanimité par le Sénat, César annonce la fin de la guerre et se prépare à la grande liesse populaire organisée en son honneur. Dans le quartier de l'Aventin, Vorenus, mandaté par César, fait campagne auprès des siens pour obtenir un siège de magistrat dans le nouveau gouvernement. Pullo, redevenu simple citoyen, est furieux qu'on lui refuse de défiler avec les soldats de la Légion au triomphe de César. Plus de force que de gré, Octave tire sa sœur Octavia de son exil au temple de Cybèle. Servilia, quant à elle, ivre de vengeance après l'humiliation publique que lui ont fait subir les hommes d'Atia, invite Quintus Pompée dans sa demeure. Ici commence la conspiration contre l'empereur.

Privé de tous ses repères, Pullo devient tueur à gages pour le compte d'un mafieux local. Exerçant ses nouvelles fonctions de magistrat, Vorenus obtient de César qu'il alloue une prime de compensation aux vétérans de la Légion. En retour, lui et Niobé sont invités à une réception donnée chez Atia, ce qui marque leur entrée dans le monde de la noblesse. Pendant ce temps, Cassius essaie de convaincre Brutus de rentrer dans la conjuration contre César.

Sortis victorieux d'un combat de gladiateurs sanglant, Pullo et Vorenus deviennent les héros de Rome. Mais Vorenus s'inquiète du sort que lui réserve César. Or ce dernier le nomme sénateur et lui demande de rester à ses côtés pendant la prochaine session du Sénat : il s'apprête à introduire de nouveaux visages et craint la colère de l'ancienne garde...

Au lendemain de l'assassinat de César, Rome est en ébullition. Non loin du Sénat, Marc Antoine, qui vient d'échapper de peu aux épées de Quintus Pompée et de ses hommes de main, décide de partir vers le nord pour y lever une armée. Il échafaude un plan pour quitter la ville avec Calpurnia (la veuve de César), Atia et son fils Octave. Ce dernier, apprenant qu'il hérite du nom et de la fortune de César, insiste pour que sa famille reste à Rome. Pénétrant avec courage dans le repaire de Servilia, Marc Antoine propose une trêve, afin de donner à César des funérailles dignes de son rang et de lever les accusations de meurtre qui pèsent sur Brutus et les «libérateurs» du Sénat. Après les obsèques, le peuple prend position en faveur de Marc Antoine ; Brutus paye cher sa soumission. Vorenus, au bord de la folie, prépare l'enterrement de Niobé. Très éprouvé, il chasse ses filles et Lucius, le fils illégitime. Pullo, de retour à Rome avec Eirene, sa nouvelle épouse (et ancienne esclave), lui vient en aide.

Cléopâtre arrive à Rome pour rendre un dernier hommage à César et pour tenter de faire reconnaître son jeune fils. Mais la venue de la reine d'Égypte intrigue Marc Antoine et contrarie Atia, qui tolère difficilement la présence d'une nouvelle rivale à la cérémonie. Afin de faire revenir l'ordre, Marc Antoine ordonne à Vorenus de reprendre son poste de capitaine alors qu'avec Pullo il négocie une trêve entre bandes rivales. Octave, maudissant sa mère et Marc Antoine qui l'ont empêché de bénéficier de son héritage, souscrit un prêt pour honorer les promesses faites au peuple par César. Les deux hommes ne peuvent s'entendre sur un projet d'alliance stratégique et de partage du pouvoir. Octave se voit contraint de quitter Rome.

Brutus et Cassius s'efforcent de trouver des fonds pour lever une armée. Démis de son titre de consul, Marc Antoine, en route pour la Macédoine, décide finalement de se rendre en Gaule. Son plan est contrecarré par Cicéron qui délivre un message in absentia au Sénat, avant d'accorder son soutien à Octave, le nouveau César. De son côté, Vorenus est engagé dans une guerre entre bandes rivales dans le Collegium de l'Aventin. Pour lui, Pullo est responsable de la rixe. Chez Atia, Octavia plane depuis des heures sous l'effet du chanvre, sans se douter que Servilia complote dans son dos.

Servilia, dont le projet de trahison a été dévoilé par Duro, se retrouve à la merci de Timon. A la recherche de Vorenus dans la campagne de Modène, Pullo rencontre Octave qui vient juste de remporter une bataille sanglante contre Marc Antoine. Le nouveau César, bien décidé à revenir à Rome avec son armée, envoie Marcus Agrippa prévenir Octavia et Cicéron. De leur côté, à l'ouest de la Turquie, dans le campement de leur nouvelle armée de mercenaires, Brutus et Cassius échafaudent leurs propres plans. Pullo et Vorenus, à la recherche des enfants.

Contre l'avis de Pullo, Vorenus retourne au Collegium avec ses filles et Lucius. Rapidement rejoints par Lyde, ils se soumettent à un rituel de purification pour se laver de leurs péchés. N'ayant pu triompher à Rome, Octave presse Cicéron de le nommer consul et lui promet de ne rien entreprendre sans l'en informer auparavant. Octave retrouve Atia et Octavia ; alors que l'une lui demande de lui accorder son pardon, l'autre n'apprécie pas l'homme que son frère est devenu. A peine nommé consul, Octave prend le Sénat et Cicéron par surprise. Vorenus tente de ramener la paix entre Memmio et Cotta, qui se demandent s'il n'a pas perdu de son impétuosité. Afin de prendre le dessus sur l'armée de Brutus et Cassius, deux adversaires acceptent de tirer un trait sur leurs divergences.

Brutus et Cassius comprennent qu'ils n'ont plus l'avantage militaire après la nouvelle alliance entre Octave et Marc Antoine. A Rome, Vorenus reçoit l'ordre d'exécuter les élites de la ville et confie cette tâche aux capitaines des bandes du Collegium. Cicéron tente d'avertir Brutus du danger encouru par son armée, mais l'arrivée de Pullo l'en empêche. Marc Antoine, tout comme Atia, ajoute quelques noms à la liste des condamnés. Octave fait route vers Rome. Dans les plaines de Philippes, deux armées s'affrontent pour l'avenir de Rome.

Servilia, qui réclame justice, profite d'un moment d'inattention de la part d'Atia et provoque un scandale en public. Octave, Marc Antoine et Lépide s'entendent sur une division des territoires romains et se répartissent le butin. Cette nouvelle coalition est immédiatement mise à l'épreuve : Marc Antoine a omis une somme importante dans le partage. Au Collegium, Eirene insiste pour que Pullo punisse l'insubordination de Gaia, qui réussit à retourner le châtiment à son avantage. Alors que Posca, récemment affranchi, convole en justes noces, Octave transforme un autre mariage en déclaration publique d'unité politique.

Octave proclame l'avènement d'une nouvelle ère de vertu à Rome, publiant des règles si strictes que sa propre famille et ses subordonnés ne peuvent s'y soumettre. Méfif iance et soupçons envahissent la ville quand un chargement d'or disparaît mystérieusement pendant son transport vers le Trésor romain. Vorenus se voit confif ier la mission de découvrir d'où vient la trahison. Après avoir fait la cour à une jeune fififfiille "digne de son rang " prénommée Livia, Octave se consacre à des affaires plus importantes et adresse à Marc Antoine un ultimatum que ce dernier ne pourra refuser.

Rome est confrontée à une pénurie de céréales ; Octave se voit contraint de traiter avec Marc Antoine pour obtenir de nouveaux approvisionnements d'Égypte, mais ce dernier rejette ses propositions, ce qui laisse présager un nouvel affrontement entre les deux hommes. En dernier recours, Octave envoie Atia et Octavia à Alexandrie, conscient qu'elles y seront froidement accueillies. Au Collegium, où Pullo continue de distribuer les céréales à des Romains de plus en plus en colère, Gaia sauve son maître de la fureur d'un animal en cage mais ne parvient pas à s'en protéger elle-même. Après avoir fui une situation désastreuse en Égypte, Posca accorde à Octave les munitions dont il a besoin pour retourner le peuple contre Marc Antoine, allumant la mèche d'un futur conflit.

Après la bataille d'Actium, Marc Antoine revient à Alexandrie et plonge dansun univers de débauche avec Cléopâtre. Octave se tourne vers Pullo pour essayer de convaincre Vorenus de lever le siège auquel il soumet le palais de Cléopâtre. Vorenus refuse mais Cléopâtre semble bien décidée à doubler Marc Antoine pour préserver sa vie, si ce n'est son honneur. L'armée d'Octave est aux portes du palais et Vorenus s'enfuit avec Césarion, fif ils tyrannique de Cléopâtre et héritier présumé de César. Octave, qui souhaite la mort de Césarion, ordonne à Pullode les suivre. Leur périple s'achève à Rome avec des retrouvailles émouvantes au Collegium alors que le triomphe d'Octave est proclamé.