Un énorme navire de guerre en forme de dragon décime une ville avec des faisceaux de plasma et des bras robotiques géants. Sa cible est le Mantle Plan, un réseau unifiant les ressources énergétiques mondiales. Alors que le navire sinistre se dirige vers sa prochaine cible, une équipe de spécialistes se lève pour le sauver : le Gatchaman. Pilotant leur vaisseau, le Phoenix, les Gatchaman lancent une contre-attaque. Une fois à l’intérieur du navire ennemi, ils se retrouvent face à face avec toute l’armée d’assassins du Galactor.

Les Gatchaman sont en difficulté et reçoivent de l’aide d’un groupe mystérieux connu sous le nom de Red Impulse. En croisière près d’une île étrange, un sous-marin est vaporisé par une grande explosion. Invoqué pour venger l’attaque, le groupe Gatchaman tombe sur le quartier général sous-marin secret de l’extraterrestre Galactor. Dans une bataille aérienne et sous-marine féroce, les Gatchaman luttent contre la Brigade de la Mort de Jupiter de Galactor et le méchant Bataillon de l’Oiseau Noir, avant de les vaincre de manière décisive. Meurtri par les combats, le Gatchaman semble être au bord de la défaite lorsque, hors du ciel, une nouvelle force apparaît dirigée par un mystérieux guerrier en rouge.

Les Gatchaman affrontent Solaris pour sauver la Terre, menacée par les machines du Galactor qui déstabilisent le climat et rendent la planète inhabitable. Joe, troublé par ses souvenirs d’enfance, découvre ses liens avec l’ennemi. Il infiltre seul le QG de Galactor et envoie ses coordonnées avant d’être capturé. Les Gatchaman, aidés de Red Impulse, lancent une attaque fatale contre la base ennemie. Malgré de lourdes pertes, une scène post-crédits révèle leur survie miraculeuse.